More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1355 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 85 aa  174  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  81.25 
 
 		 82 aa  140  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  74.39 
 
 		 85 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  72.94 
 
 		 85 aa  130  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  73.49 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  74.39 
 
 		 85 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  71.76 
 
 		 102 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 88 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  66.25 
 
 		 86 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  57.69 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 93 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  60 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 96 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  54.76 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  61.25 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  54.76 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 86 aa  95.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 107 aa  95.1  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2056  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000496766  normal  0.0517422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 86 aa  94.7  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  59.49 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  56.47 
 
 		 86 aa  94.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  57.32 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 84 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 84 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 82 aa  93.6  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  50.6 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  56.25 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  58.97 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  61.43 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>