More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0689 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 82 aa  166  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  81.25 
 
 		 85 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  80 
 
 		 85 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  80 
 
 		 85 aa  134  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  81.25 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  76.25 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  75 
 
 		 85 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  58.11 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 99 aa  100  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  60.27 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  97.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  57.14 
 
 		 96 aa  97.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  53.75 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  53.75 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  53.75 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  61.43 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  61.43 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  62.86 
 
 		 85 aa  94.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  67.19 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  54.43 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  57.97 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  53.75 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 91 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  53.75 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 87 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 98 aa  93.6  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  51.9 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  61.43 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 86 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  55.07 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  55 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  55.13 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 83 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>