More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0717 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  100 
 
 		 85 aa  173  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 96 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 84 aa  106  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  60.49 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  60.49 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  60.49 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  54.32 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  60.76 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  51.81 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 87 aa  99.4  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  57.69 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  54.76 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  53.75 
 
 		 84 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  59.74 
 
 		 82 aa  96.7  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  54.76 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  55.26 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  52 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  51.85 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  61.64 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  54.76 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 82 aa  94.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>