More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0942 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 85 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  97.65 
 
 		 85 aa  167  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  90.24 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  85.37 
 
 		 85 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  80.49 
 
 		 85 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  80 
 
 		 82 aa  134  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  73.49 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  68.35 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  67.09 
 
 		 86 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  65 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  61.25 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 93 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 99 aa  103  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 84 aa  103  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  62.03 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  60.49 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 85 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 88 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  59.26 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  60 
 
 		 98 aa  97.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  60 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  56.79 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 91 aa  95.9  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  58.02 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 87 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 96 aa  94.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  54.32 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  52.33 
 
 		 86 aa  94.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 86 aa  94.7  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  57.65 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  60 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  54.32 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  56 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  55 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  55.13 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 		 84 aa  90.9  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  51.85 
 
 		 120 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  55 
 
 		 99 aa  90.5  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  52.63 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  55 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  56.25 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  56 
 
 		 88 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  55 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 83 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>