More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3712 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  100 
 
 		 86 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  83.13 
 
 		 83 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  86.08 
 
 		 81 aa  144  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  84.81 
 
 		 80 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  84.81 
 
 		 80 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  77.22 
 
 		 83 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  82.28 
 
 		 82 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3003  SSU ribosomal protein S17P  71.95 
 
 		 83 aa  125  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6556  hitchhiker  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  69.14 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  67.9 
 
 		 98 aa  124  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  65.88 
 
 		 88 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  68.75 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1641  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17561  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17311  30S ribosomal protein S17  67.5 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.356894  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17401  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1120  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19941  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  69.44 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  70.42 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  65.28 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 90 aa  100  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  63.16 
 
 		 93 aa  97.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 135 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 99 aa  94.7  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  68.06 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  67.65 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 86 aa  94.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  60 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  60.81 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  59.72 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 85 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  60.56 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0235  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 		 87 aa  90.5  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 91 aa  90.5  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  53.33 
 
 		 87 aa  90.1  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  56.76 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  56.76 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  56.76 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  65.15 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  65.15 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 86 aa  88.6  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  59.46 
 
 		 100 aa  88.6  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  65.15 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>