More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3003 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3003  SSU ribosomal protein S17P  100 
 
 		 83 aa  167  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6556  hitchhiker  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  78.48 
 
 		 80 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  78.48 
 
 		 80 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  72.84 
 
 		 81 aa  130  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  70.73 
 
 		 83 aa  130  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 86 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  73.42 
 
 		 82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  70.89 
 
 		 83 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  69.74 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1641  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17311  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.356894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  70.27 
 
 		 84 aa  103  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17401  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17561  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 88 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1120  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 88 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19941  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 88 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  61.43 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  62.86 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 92 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  60.81 
 
 		 96 aa  91.7  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  56.58 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  61.64 
 
 		 93 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  54.05 
 
 		 85 aa  88.6  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9652  Plastid ribosomal protein S17 small ribosomal subunit  56.76 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0200379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  60.81 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  59.72 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  56.76 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  56.76 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1235  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 		 101 aa  87.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574197  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  56.76 
 
 		 99 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  56.76 
 
 		 99 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 82 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>