More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_9652 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_9652  Plastid ribosomal protein S17 small ribosomal subunit  100 
 
 
90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0200379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  60 
 
 
90 aa  102  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  51.81 
 
 
101 aa  90.9  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
82 aa  89.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
82 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
82 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
82 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3003  SSU ribosomal protein S17P  56.76 
 
 
83 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6556  hitchhiker  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  49.35 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  49.35 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 
90 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  48.05 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  54.67 
 
 
86 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 
88 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 
88 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  50 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  50 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  56 
 
 
80 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
99 aa  86.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  56 
 
 
80 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
89 aa  85.9  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
82 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 
90 aa  85.9  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
82 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
89 aa  85.9  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 
87 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  48.65 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  51.39 
 
 
85 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  54.55 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
107 aa  84.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  48.68 
 
 
120 aa  84.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  54.93 
 
 
87 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  45.83 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 
90 aa  83.6  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  55.88 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0990  ribosomal protein S17  50 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.788339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  47.3 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2363  ribosomal protein S17  48.05 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.577527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  52 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  48.65 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
83 aa  82  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  58.82 
 
 
83 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  46.75 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  51.16 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  52 
 
 
83 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04512  30S ribosomal protein S17  52 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.003321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  50.68 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  48.61 
 
 
83 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  54.17 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  52.94 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  52.94 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 
86 aa  80.1  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  50 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000099877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>