More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0282 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  100 
 
 		 90 aa  181  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  74.03 
 
 		 80 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  74.03 
 
 		 80 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  67.9 
 
 		 101 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  65.38 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 82 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3003  SSU ribosomal protein S17P  69.74 
 
 		 83 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6556  hitchhiker  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  69.86 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0274  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 92 aa  104  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000911051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  56.96 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 83 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  53.49 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 		 84 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 87 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9652  Plastid ribosomal protein S17 small ribosomal subunit  60 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0200379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 83 aa  102  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0435  ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266515  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  64 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 86 aa  100  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  55.06 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  55.06 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  50.6 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  51.81 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  51.81 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 88 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 		 83 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  45.56 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04512  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.003321  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  45.56 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 87 aa  99.4  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  56.98 
 
 		 96 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2363  ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 86 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.577527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  64.2 
 
 		 86 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  65 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 84 aa  97.1  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0765  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000334352  normal  0.110836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>