More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0962 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 99 aa  200  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  68 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  69.62 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  60.76 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  65.38 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 99 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 84 aa  98.2  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 89 aa  97.8  5e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 84 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  48.89 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  58.9 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 85 aa  95.9  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 85 aa  95.9  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 86 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2363  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.577527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 90 aa  93.2  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  53.75 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  63.77 
 
 		 82 aa  92.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>