More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2765 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
88 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  71.59 
 
 
88 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  71.59 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2056  30S ribosomal protein S17  65.91 
 
 
88 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000496766  normal  0.0517422 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  78.21 
 
 
87 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  67.05 
 
 
88 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  60.76 
 
 
99 aa  101  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
88 aa  98.6  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 
86 aa  98.2  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  58.14 
 
 
85 aa  98.2  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  57.47 
 
 
85 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  54.55 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  53.41 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  55.68 
 
 
99 aa  96.7  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
85 aa  96.7  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  54.43 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  55.81 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 
84 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  60.81 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  51.72 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  53.41 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  56.96 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  53.41 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 
84 aa  95.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  53.41 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  56.41 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  53.41 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 
100 aa  94.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  57.65 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  55 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  57.65 
 
 
85 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  55.13 
 
 
84 aa  94  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 
87 aa  93.2  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  55.13 
 
 
85 aa  92.8  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  54.22 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  54.22 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
88 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  52.17 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  54.32 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  53.66 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  51.14 
 
 
96 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  52.27 
 
 
88 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  52.27 
 
 
88 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  52.87 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  52.87 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  53.75 
 
 
86 aa  90.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 
93 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2363  ribosomal protein S17  55.13 
 
 
86 aa  90.1  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.577527  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  54.32 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 
84 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  48.84 
 
 
93 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  52.81 
 
 
92 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  54.02 
 
 
86 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000099877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  51.22 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  56.41 
 
 
85 aa  89.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  51.69 
 
 
92 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  50 
 
 
89 aa  89  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  52.44 
 
 
84 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  54.02 
 
 
90 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  54.43 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  51.81 
 
 
85 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 
85 aa  88.6  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  48.86 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  51.22 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  51.72 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  54.55 
 
 
87 aa  87.8  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  52.56 
 
 
85 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  52.87 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  52.87 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  52.38 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>