More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2056 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2056  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000496766  normal  0.0517422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  65.91 
 
 		 88 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  67.05 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  67.05 
 
 		 88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  73.08 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  67.86 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  54.32 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  51.81 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 99 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  49.43 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  53.57 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 85 aa  90.5  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 88 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 88 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  48.1 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  49.37 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  56.16 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  50.6 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  53.85 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  49.37 
 
 		 85 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  51.19 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  53.09 
 
 		 84 aa  87.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  48.75 
 
 		 87 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  48.75 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  52.7 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  50.59 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  52.33 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  52.38 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  53.16 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 101 aa  84.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  51.85 
 
 		 84 aa  84.3  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  51.76 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  48.78 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  51.76 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  57.53 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 91 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 98 aa  84  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 85 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  55.13 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  49.41 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 85 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  48.28 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  48.28 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  50.59 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  47.5 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  50.65 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2363  ribosomal protein S17  50 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.577527  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  48.19 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000099877  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  48.19 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  48.28 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  48.81 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  48.72 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  50.63 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>