More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2679 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  65.38 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 78 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 79 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 79 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 80 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 80 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 80 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 80 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 80 aa  101  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 80 aa  101  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 82 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 		 76 aa  98.6  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 80 aa  98.6  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 76 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 76 aa  97.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 82 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 82 aa  96.7  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 82 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 82 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 80 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  58.9 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 82 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 82 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 87 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 82 aa  94  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  56.34 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  60.56 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 97 aa  90.5  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 		 82 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  62.16 
 
 		 86 aa  88.6  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 84 aa  88.6  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 84 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  61.11 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  55.56 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0864  ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 83 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549145  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  57.35 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>