More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2223 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  81.01 
 
 		 81 aa  135  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  82.28 
 
 		 86 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  79.75 
 
 		 80 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  79.75 
 
 		 80 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  79.75 
 
 		 83 aa  133  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  77.22 
 
 		 83 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3003  SSU ribosomal protein S17P  73.42 
 
 		 83 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6556  hitchhiker  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  72.73 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  71.43 
 
 		 98 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  71.43 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1641  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 88 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17311  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.356894  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17561  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 88 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17401  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 88 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  69.33 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  72 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1120  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19941  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  68 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  71.83 
 
 		 94 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  66.67 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  66.67 
 
 		 100 aa  100  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  64.94 
 
 		 93 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  64 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 92 aa  98.6  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 98 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  62.67 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  61.97 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  64 
 
 		 90 aa  95.9  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 90 aa  95.9  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  64.38 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  60 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  66.18 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  61.11 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  61.97 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 94 aa  94.4  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 99 aa  94  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  64 
 
 		 94 aa  94  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 87 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  56 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 85 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 88 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 99 aa  92  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  58.67 
 
 		 99 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>