More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1688 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
82 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  77.22 
 
 
86 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  73.75 
 
 
80 aa  126  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  75.32 
 
 
88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  75.32 
 
 
88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  78.38 
 
 
81 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  74.68 
 
 
82 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  74.68 
 
 
82 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  73.75 
 
 
85 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  75.32 
 
 
82 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  73.42 
 
 
82 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  75.32 
 
 
88 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  74.03 
 
 
82 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  74.07 
 
 
80 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  72.73 
 
 
78 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  70.13 
 
 
87 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  72.73 
 
 
82 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  72.73 
 
 
82 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  74.03 
 
 
79 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  74.03 
 
 
79 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  72.73 
 
 
78 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  70.67 
 
 
80 aa  117  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  70.67 
 
 
80 aa  117  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  72.73 
 
 
80 aa  115  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  72.73 
 
 
80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  72.73 
 
 
80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  74.32 
 
 
78 aa  114  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  70.13 
 
 
78 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  70.27 
 
 
79 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  67.11 
 
 
76 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
80 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
76 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
80 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
80 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  64 
 
 
83 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
82 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  68.49 
 
 
90 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 
92 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
79 aa  96.7  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 
76 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  63.89 
 
 
86 aa  94.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
100 aa  94  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  74.32 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 
92 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
92 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  69.33 
 
 
88 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 
97 aa  88.6  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 
94 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  68 
 
 
86 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  56.41 
 
 
88 aa  87.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  56.41 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  53.75 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  60.29 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  60.29 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  58.82 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  60.87 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  55.71 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
87 aa  84  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 
90 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 
90 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 
90 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4904  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 
89 aa  84  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.049648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 
90 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0212  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 
89 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.149422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  58.57 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 
91 aa  83.6  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  58.57 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  55.84 
 
 
87 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1273  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468178  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  59.72 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>