More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0263 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 76 aa  155  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  90.54 
 
 		 76 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  79.73 
 
 		 76 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  78.38 
 
 		 82 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  78.38 
 
 		 80 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  78.38 
 
 		 80 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  78.38 
 
 		 80 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  68.42 
 
 		 79 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  68.42 
 
 		 79 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  69.74 
 
 		 78 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 		 78 aa  113  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  67.11 
 
 		 78 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 		 80 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 		 80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 		 80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  68.42 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 79 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 80 aa  104  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  67.11 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 87 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 		 80 aa  102  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 		 80 aa  102  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 		 86 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 82 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 82 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 82 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 79 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 80 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 92 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  54.67 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 86 aa  83.6  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  52.17 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  50.68 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  52.17 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  60.94 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  53.42 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  51.47 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  54.41 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  55.07 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  46.58 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  49.35 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4904  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.049648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  51.47 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  49.3 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  49.3 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  49.28 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  52.11 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  49.32 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  51.47 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  56 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  50.72 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  50.68 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  48.53 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  51.47 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  47.95 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0212  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1273  30S ribosomal protein S17  53.62 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  54.41 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  48.61 
 
 		 82 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3786  30S ribosomal protein S17  52.17 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164158  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  48.61 
 
 		 82 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  48.61 
 
 		 82 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  48.61 
 
 		 82 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  52.05 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  52.11 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  45.21 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  48.61 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  51.43 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>