More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0294 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 76 aa  157  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  90.54 
 
 		 76 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  80.26 
 
 		 76 aa  133  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  76.32 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  76.32 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  76.32 
 
 		 80 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  75.68 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 79 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  65.79 
 
 		 80 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 78 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 81 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 		 82 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 78 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 82 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 80 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 79 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 80 aa  97.1  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  54.79 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  50.67 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  51.39 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  51.39 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  52.78 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  48.65 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1120  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19941  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  53.03 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  55.07 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  48.61 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  53.03 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  51.47 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  53.73 
 
 		 86 aa  76.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  53.62 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  50.7 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  52.24 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  52.24 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  53.62 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  53.03 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  51.39 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  47.22 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  52.17 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  49.25 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  55.41 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  50.72 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  53.03 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  53.73 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  51.52 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2160  30S ribosomal protein S17  51.39 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0103749  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  48.61 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  51.52 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  51.43 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  48.57 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  54.29 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4904  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.049648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>