More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1344 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  84.42 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  79.75 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  67.11 
 
 		 79 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 79 aa  104  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  68 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  63.16 
 
 		 83 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  65.79 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 78 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  67.11 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  58.14 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 		 80 aa  98.6  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 79 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 82 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 		 87 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 80 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 80 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  61.33 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 80 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0765  30S ribosomal protein S17  63.89 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000334352  normal  0.110836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 80 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04512  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.003321  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 80 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 94 aa  93.6  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 78 aa  93.6  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  56 
 
 		 80 aa  93.6  9e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  56 
 
 		 80 aa  93.6  9e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 76 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  64.79 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 		 88 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1273  30S ribosomal protein S17  65.22 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  59.72 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  59.72 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 88 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 88 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3786  30S ribosomal protein S17  62.32 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164158  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  53.33 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  61.97 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4904  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.049648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>