More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2525 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
80 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  96.25 
 
 
80 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  96.25 
 
 
80 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  86.84 
 
 
82 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  77.03 
 
 
76 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  76.32 
 
 
76 aa  124  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  77.33 
 
 
78 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  76 
 
 
78 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  78.38 
 
 
76 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  73.33 
 
 
79 aa  119  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  73.33 
 
 
79 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  72 
 
 
80 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  72 
 
 
80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  72 
 
 
80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  65 
 
 
80 aa  110  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  65 
 
 
80 aa  110  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  71.05 
 
 
80 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  65.79 
 
 
78 aa  105  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
78 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 
80 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
81 aa  103  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
87 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
82 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 
79 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
92 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
82 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
82 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 
82 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 
82 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 
82 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  61.84 
 
 
83 aa  97.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 
79 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 
90 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
86 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  60.56 
 
 
88 aa  89.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0212  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.149422 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  54.17 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  54.17 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  56.34 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 
107 aa  84  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0265  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 
89 aa  83.6  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.696196  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  57.97 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
88 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  51.39 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  56.72 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3786  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164158  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1273  30S ribosomal protein S17  55.07 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468178  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3329  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000398832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  51.47 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  55.07 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4904  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.049648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  59.46 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  55.07 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0765  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000334352  normal  0.110836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  51.39 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  59.7 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  53.73 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  53.52 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>