More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1858 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 94 aa  190  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  63.41 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 92 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 98 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  58.97 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4904  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.049648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  55.79 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1273  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0265  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.696196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  57.78 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3786  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0212  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149422 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 		 96 aa  94.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  54.74 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  44.94 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  53.75 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  53.12 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  55.26 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  56.04 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 84 aa  90.5  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 87 aa  90.5  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  55.26 
 
 		 87 aa  90.5  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 		 88 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  53.16 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  54.43 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0332  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000351608  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  52.69 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 82 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  59.74 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  47.5 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 85 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 79 aa  88.2  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 85 aa  88.2  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 		 79 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 85 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>