More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1363 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 80 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  89.61 
 
 		 81 aa  142  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  73.75 
 
 		 82 aa  126  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  70 
 
 		 85 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  72.15 
 
 		 86 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  73.42 
 
 		 79 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  72.15 
 
 		 82 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  72.15 
 
 		 79 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  72.15 
 
 		 82 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  74.32 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  74.67 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  73.08 
 
 		 78 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  74.32 
 
 		 82 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  69.23 
 
 		 80 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  69.23 
 
 		 80 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  74.67 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  74.67 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 		 80 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 		 80 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 		 80 aa  117  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  69.62 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  69.62 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  73.33 
 
 		 87 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  71.79 
 
 		 78 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 78 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  70.51 
 
 		 78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  68 
 
 		 80 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 		 76 aa  104  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 80 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 		 82 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 80 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 80 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  65.38 
 
 		 79 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 76 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 		 79 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  57.5 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 		 76 aa  94.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  54.55 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 		 100 aa  87.4  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  61.76 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  60.29 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 98 aa  84.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4904  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.049648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  57.35 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1273  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 89 aa  83.6  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  62.67 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3786  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  50.65 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>