More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1373 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 82 aa  169  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  97.56 
 
 		 82 aa  167  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  97.56 
 
 		 82 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  96.34 
 
 		 82 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  95.12 
 
 		 82 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  93.9 
 
 		 82 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  93.9 
 
 		 82 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  74.68 
 
 		 82 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  73.08 
 
 		 81 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  69.51 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  74.32 
 
 		 80 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  71.43 
 
 		 78 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  68.83 
 
 		 79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 80 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  68.83 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 80 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 80 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  68.83 
 
 		 78 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 80 aa  110  9e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 80 aa  110  9e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 		 78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 		 80 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  64.94 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  70.27 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 76 aa  99.4  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 76 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 80 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 80 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 		 80 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  60.76 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 82 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  60.27 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 79 aa  94.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 		 76 aa  94  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 97 aa  94  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  61.43 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  60.56 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  59.72 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0212  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1273  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  62.86 
 
 		 87 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3786  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4904  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.049648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 94 aa  87  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0265  30S ribosomal protein S17  53.75 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.696196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  56.94 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>