More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0600 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
76 aa  157  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  80.26 
 
 
76 aa  133  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  77.03 
 
 
80 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  77.03 
 
 
80 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  77.03 
 
 
80 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  79.73 
 
 
76 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  72.97 
 
 
82 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 
78 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 
78 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
80 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
80 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 
80 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 
80 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
78 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  60.81 
 
 
78 aa  100  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
79 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 
87 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 
80 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 
81 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 
80 aa  94.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
79 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 
82 aa  94  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 
82 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 
82 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 
82 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 
90 aa  92  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 
86 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
85 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  53.42 
 
 
83 aa  87  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 
97 aa  86.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  48.65 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
97 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  52.11 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  47.89 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  47.89 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  53.03 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19941  30S ribosomal protein S17  49.32 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1120  30S ribosomal protein S17  49.32 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  53.62 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  52.24 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  53.03 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  47.89 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  51.52 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0400  30S ribosomal protein S17  55.07 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  47.3 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  51.52 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  48.53 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  58.11 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0414  30S ribosomal protein S17  55.71 
 
 
87 aa  77  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000036421  normal  0.356143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  51.43 
 
 
90 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  47.22 
 
 
86 aa  77  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  52.17 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  52.17 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  49.25 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  47.22 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  47.14 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  48.65 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  48.61 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
82 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  53.52 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>