More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0274 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0274  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000911051  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  66.67 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  64 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  54.79 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 93 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1641  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 86 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  52.63 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04512  30S ribosomal protein S17  48.86 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.003321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 84 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17401  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  50 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_008816  A9601_17561  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  51.85 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  54.65 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  52.56 
 
 		 82 aa  88.2  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 85 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 84 aa  87.8  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17311  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.356894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  51.9 
 
 		 85 aa  87.4  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  55.81 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  53.25 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  56 
 
 		 81 aa  86.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 88 aa  87  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  46.15 
 
 		 82 aa  86.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  56 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  54.79 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  48.68 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0765  30S ribosomal protein S17  47.67 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000334352  normal  0.110836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0442  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00168249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  54.55 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  54.55 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0864  ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  54.67 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>