More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0864 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0864  ribosomal protein S17  100 
 
 
83 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549145  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  70.89 
 
 
82 aa  124  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  67.47 
 
 
85 aa  123  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 
82 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 
82 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 
82 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 
82 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 
82 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  69.62 
 
 
82 aa  120  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  67.09 
 
 
82 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  65.06 
 
 
83 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  67.47 
 
 
82 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  68.35 
 
 
82 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  64.63 
 
 
83 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 
82 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  70.13 
 
 
88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  67.09 
 
 
82 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 
82 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  67.09 
 
 
82 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  67.09 
 
 
82 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  67.09 
 
 
82 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0765  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 
89 aa  116  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000334352  normal  0.110836 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04512  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 
89 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.003321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  64.63 
 
 
88 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 
88 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 
88 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  66.27 
 
 
84 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  62.35 
 
 
88 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  62.35 
 
 
88 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0435  ribosomal protein S17  65.06 
 
 
95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266515  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0442  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 
88 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00168249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
88 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
88 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
88 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 
88 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  63.53 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  68.92 
 
 
91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  62.65 
 
 
86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0503  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00731463  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  68.92 
 
 
91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  62.34 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  65.38 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  60.71 
 
 
86 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  64.56 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 
88 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 
84 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  63.86 
 
 
84 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  64.38 
 
 
101 aa  104  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 
84 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 
84 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 
84 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 
84 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  63.29 
 
 
84 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  63.86 
 
 
84 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 
90 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 
90 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  64.56 
 
 
84 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
88 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  63.29 
 
 
84 aa  102  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 
84 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  61.73 
 
 
86 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 
84 aa  100  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
84 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2363  ribosomal protein S17  56.1 
 
 
86 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.577527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0304  ribosomal protein S17  57.32 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000983019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2750  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000100032  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  57.14 
 
 
84 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0332  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 
89 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000351608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  61.25 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  61.25 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 
86 aa  98.6  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  58.44 
 
 
98 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3635  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000372531  decreased coverage  0.00000000000123606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  59.04 
 
 
85 aa  98.2  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
90 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  63.01 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>