More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0460 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0460  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 90 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000738553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_426  ribosomal protein S17  98.85 
 
 		 89 aa  174  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122095  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0483  30S ribosomal protein S17  94.05 
 
 		 86 aa  163  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269682  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  48.75 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  58.44 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  48.24 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  49.37 
 
 		 85 aa  93.6  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 85 aa  89.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 84 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  50.65 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 85 aa  88.2  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  52.44 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  53.42 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  53.42 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  47.13 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 84 aa  84.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  46.43 
 
 		 86 aa  84.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1842  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0587769  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  49.35 
 
 		 84 aa  84.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  58.57 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  49.37 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  49.37 
 
 		 101 aa  84.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0332  30S ribosomal protein S17  49.37 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000351608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  47.5 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  55.7 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  84.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  50.65 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  45.33 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  52.38 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  50.65 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  47.56 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  46.67 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2287  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000132809  hitchhiker  0.00277508 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  49.37 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  49.37 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  50 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  53.42 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  50.65 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0990  ribosomal protein S17  50.57 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.788339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  49.37 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  45.24 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  49.35 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  45.24 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  49.4 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  51.9 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  48.75 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  49.35 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  44.32 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  45.68 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  49.35 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0068  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>