More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0806 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0806  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
83 aa  164  4e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00619499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  59.21 
 
 
101 aa  91.3  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 
86 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 
86 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  59.21 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  59.21 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  59.21 
 
 
99 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  53.09 
 
 
90 aa  84  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 
88 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  61.64 
 
 
112 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  57.33 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  55.13 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  60.53 
 
 
94 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0990  ribosomal protein S17  57.89 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.788339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  56.58 
 
 
87 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  56.58 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
83 aa  82  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  61.11 
 
 
107 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 
80 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  56 
 
 
81 aa  82  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 
80 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  56.25 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  50.62 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3712  ribosomal protein S17  58.67 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  55.41 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  55.26 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
93 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  53.95 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  55.7 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1301  ribosomal protein S17  56.94 
 
 
83 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  57.89 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1235  30S ribosomal protein S17  53.42 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574197  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  58.67 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  56.25 
 
 
99 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  53.33 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  59.72 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  56.58 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  46.91 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  46.91 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  58.67 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3003  SSU ribosomal protein S17P  54.29 
 
 
83 aa  77  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6556  hitchhiker  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  57.53 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0235  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 
84 aa  77  0.00000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  60.87 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
88 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  52 
 
 
85 aa  77  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0435  ribosomal protein S17  57.14 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266515  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  55.26 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  61.19 
 
 
80 aa  76.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  53.95 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  61.19 
 
 
80 aa  76.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  48.72 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  53.16 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  56.58 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  48.15 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  54.43 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  58.21 
 
 
81 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  50.62 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  48.15 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1349  30S ribosomal protein S17  49.33 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  54.17 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>