71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0516 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  100 
 
 		 152 aa  309  7.999999999999999e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  58.02 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  54.14 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  56.49 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  52.85 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  50.46 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  53.77 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  49.06 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  46.08 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  48.39 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  48.04 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  48.54 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  46.08 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  43.81 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  45.63 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  45.74 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  41.9 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  43.14 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  44.09 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  39.81 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  51.92 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  39.05 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  39.05 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  39.05 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  44.68 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  44.68 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  47.83 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  43.81 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  44.68 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  48.84 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  36.28 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  41.28 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  41.9 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  33.68 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  36.23 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  44.26 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  34.67 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  41.79 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  40.28 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  40.28 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  39.44 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  36.62 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  42.62 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  38.89 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  41.94 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 88 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 88 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  38.89 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  41.79 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  41.79 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  35.71 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  38.75 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  35.21 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>