57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0801 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 107 aa  222  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  51.89 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  50 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  50.47 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  49.5 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  49.5 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  49.5 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  47.52 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  48.04 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  47.62 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  47.66 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  44.76 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  46.6 
 
 		 111 aa  106  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  44.23 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  45.19 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  41.58 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  42.42 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  44.57 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  43.14 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  39.81 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  36.89 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  41.12 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  40.19 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.51 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  38.68 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  36.45 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  40 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  34.86 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  40.91 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  35.51 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  37.86 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  39.81 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  36.89 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1349  30S ribosomal protein S17  35.37 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  35.53 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  35.53 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  35.53 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  35.53 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  30.77 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  34.62 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  34.62 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  34.62 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  34.62 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  34.62 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  32.89 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  36.11 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  32.89 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  32.43 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  30.67 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  32.05 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  29.63 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  31.43 
 
 		 87 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  31.58 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  31.08 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  31.08 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0503  30S ribosomal protein S17  31.43 
 
 		 89 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00731463  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  32.86 
 
 		 84 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>