55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1769 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  100 
 
 		 114 aa  229  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  69.52 
 
 		 111 aa  154  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  56.19 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  53.77 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  55.21 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  50 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  51.4 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  51.04 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  51.02 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  46.6 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  51.02 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  51.04 
 
 		 108 aa  106  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  50 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  49.49 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  48.96 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  46.46 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  46.46 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  46.46 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  46.39 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  44.57 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  48.04 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  50.93 
 
 		 109 aa  97.1  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  55.24 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  51.43 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  53.33 
 
 		 146 aa  93.2  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  43.02 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  45.35 
 
 		 160 aa  87.4  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  43.02 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  39.08 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  41.86 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  48.89 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  50 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  50 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  32.43 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  35.06 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  40.26 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  36.36 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  40.26 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  40.26 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  40.26 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  31.08 
 
 		 84 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2056  30S ribosomal protein S17  39.68 
 
 		 88 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000496766  normal  0.0517422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  32.93 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  38.46 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  38.24 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  38.6 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  32.39 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  33.33 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_002620  TC0806  30S ribosomal protein S17  33.73 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00619499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>