190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0719 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  100 
 
 		 109 aa  223  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  88.99 
 
 		 109 aa  203  7e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  88.99 
 
 		 109 aa  203  7e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  88.99 
 
 		 109 aa  203  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  73.58 
 
 		 109 aa  165  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  58.25 
 
 		 106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  56.86 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  59.41 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  56.44 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  53.47 
 
 		 108 aa  129  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  55.45 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  54.46 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  52.48 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  63.46 
 
 		 109 aa  120  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  47.52 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  47.52 
 
 		 108 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  48.48 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  51.02 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  45.71 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  43.12 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  42.86 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  44.66 
 
 		 111 aa  92  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  39.62 
 
 		 166 aa  90.9  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  42.86 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  44.55 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  45.28 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  42.2 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  46.67 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  44.34 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  41.28 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  40.37 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  42.2 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  41.28 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  34.62 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2287  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000132809  hitchhiker  0.00277508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  43.66 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  36.11 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2056  30S ribosomal protein S17  37.68 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000496766  normal  0.0517422 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  40.79 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 82 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  37.21 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 82 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 82 aa  47.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 82 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 82 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  43.48 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  43.48 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  38.46 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  42.03 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  41.43 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  44.07 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  38.82 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  38.36 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1349  30S ribosomal protein S17  32 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  39.13 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  42.37 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  36.9 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  42.37 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  37.5 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  37.14 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  36.99 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  38.96 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  38.16 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  37.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  38.96 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  33.75 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1842  30S ribosomal protein S17  38.82 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0587769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  37.93 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  29.63 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  40.68 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  37.33 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0765  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000334352  normal  0.110836 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>