More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2227 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  100 
 
 
144 aa  287  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  88.19 
 
 
147 aa  256  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  86.11 
 
 
114 aa  190  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  66.06 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  68.22 
 
 
108 aa  138  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  57.8 
 
 
106 aa  114  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  56.6 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  54.55 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  54.72 
 
 
109 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  56.36 
 
 
108 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  54.13 
 
 
108 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  42.02 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  49.06 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  52.29 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  51.38 
 
 
108 aa  96.7  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  48.62 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  48.62 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  48.62 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  41.96 
 
 
155 aa  90.9  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.290781 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  42.99 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  47.22 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  39.81 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  40.19 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  41.41 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  48.84 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  46.67 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  50 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  43.69 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  51.89 
 
 
109 aa  73.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  44.05 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  45.45 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  46.25 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  36.78 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  44.44 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  45 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  45 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  46.05 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  41.67 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  46.05 
 
 
84 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  40.74 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  44.16 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  42.17 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  44 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  42.5 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  45.45 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  40.74 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  44.16 
 
 
82 aa  57.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  42.86 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  40.74 
 
 
87 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0346  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000061792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  40.74 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  44.44 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1845  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.018773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  43.04 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  43.04 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  43.04 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  47.67 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  41.56 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  39.77 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  38.75 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  46.34 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  42.11 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  44.3 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2287  30S ribosomal protein S17  41.98 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000132809  hitchhiker  0.00277508 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  41.56 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>