More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0101 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  100 
 
 		 109 aa  225  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  76.64 
 
 		 109 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  66.35 
 
 		 108 aa  157  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  62.96 
 
 		 108 aa  146  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  62.04 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  65.69 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  61.54 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  58.65 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  60.78 
 
 		 108 aa  129  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  56.86 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  59.6 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  55.45 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  56.44 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  56.44 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  56.44 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  60.78 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  56.6 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  49.06 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  54.72 
 
 		 114 aa  106  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  45.28 
 
 		 153 aa  105  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  50 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  62.35 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  45.19 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  44.34 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  45.63 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  40.91 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  40.57 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  45.1 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  46.23 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  45.63 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  41.75 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  41.3 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  42.16 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1845  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.018773  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0346  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000061792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  44.59 
 
 		 86 aa  62  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  47.14 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  47.14 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  43.66 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  39.73 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  45.33 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  47.95 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  47.89 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  43.24 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  43.24 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  45 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  44.74 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  47.95 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  44.58 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  46.58 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  47.95 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  47.3 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  40.26 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  47.14 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  45.33 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  40 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  45.33 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  45.21 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  45.33 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  45.33 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  45.07 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  37.33 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  40.54 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  40.54 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  40.54 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  45.95 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  45.95 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  40.54 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  45.95 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  42.47 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  40.54 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  40.54 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  45.33 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  39.71 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  40.54 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0498  30S ribosomal protein S17  47.14 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  40.54 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  40.54 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  40.54 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  40.54 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  45.21 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0323  30S ribosomal protein S17  45.07 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000666609  decreased coverage  0.00233353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>