160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1136 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1136  fatty acid desaturase  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00601185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3564  fatty acid desaturase  69.48 
 
 		 249 aa  362  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392803  normal  0.531214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1354  fatty acid desaturase  55.65 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1595  fatty acid desaturase (stearoyl-CoA desaturase)  59.83 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0170967  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0451  fatty acid desaturase  56.56 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10163  fatty acid desaturase  57.08 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4336  fatty acid desaturase  54.88 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  hitchhiker  0.00142365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4048  fatty acid desaturase  54.36 
 
 		 256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295457  normal  0.0470616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1686  fatty-acid desaturase  52.5 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.726488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3484  fatty acid desaturase  52.65 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  28.46 
 
 		 407 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2450  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  29.22 
 
 		 398 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2642  Fatty acid desaturase  27.69 
 
 		 389 aa  99.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2775  Fatty acid desaturase  27.69 
 
 		 389 aa  98.6  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  29.05 
 
 		 396 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  29.05 
 
 		 396 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  28.23 
 
 		 399 aa  96.3  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  29.17 
 
 		 394 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  29.02 
 
 		 395 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 412 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1828  fatty acid desaturase  26.53 
 
 		 389 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.665494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  27.05 
 
 		 396 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4308  fatty acid desaturase  30.17 
 
 		 396 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  28.1 
 
 		 397 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03730  putative fatty acid desaturase  29.31 
 
 		 392 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0377  putative fatty acid desaturase  29.31 
 
 		 392 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0217  fatty acid desaturase  27.73 
 
 		 394 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  26.56 
 
 		 404 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  29.96 
 
 		 394 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0232  fatty acid desaturase  29.11 
 
 		 394 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  28.05 
 
 		 412 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0618  hypothetical protein  30.3 
 
 		 395 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0601  hypothetical protein  30.3 
 
 		 395 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0972  fatty acid desaturase family protein  25.5 
 
 		 397 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0241  fatty acid desaturase  28.69 
 
 		 394 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3432  fatty acid desaturase  29.96 
 
 		 404 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.820989  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4995  fatty acid desaturase  27.5 
 
 		 394 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.702334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5839  Fatty acid desaturase  26.29 
 
 		 397 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  26.64 
 
 		 384 aa  88.6  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  26.64 
 
 		 384 aa  89  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1896  fatty acid desaturase  26.29 
 
 		 398 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2554  fatty acid desaturase  25.5 
 
 		 398 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2507  fatty acid desaturase  26.29 
 
 		 398 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2532  fatty acid desaturase  26.29 
 
 		 398 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2425  fatty acid desaturase  25.5 
 
 		 398 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0695745  hitchhiker  0.0000498345 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2237  fatty acid desaturase family protein  25.5 
 
 		 398 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0317102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0775  fatty acid desaturase family protein  25.9 
 
 		 397 aa  88.6  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2653  fatty acid desaturase family protein  25.5 
 
 		 398 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1028  fatty acid desaturase family protein  25.5 
 
 		 398 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0976  fatty acid desaturase family protein  25.5 
 
 		 398 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2594  fatty acid desaturase  27.97 
 
 		 390 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583715  normal  0.31679 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1130  fatty acid desaturase family protein  25.5 
 
 		 397 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  28.05 
 
 		 403 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2107  fatty acid desaturase family protein  25.5 
 
 		 397 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0788  fatty acid desaturase  26.29 
 
 		 397 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0567815  normal  0.0980312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3154  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 398 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357415  normal  0.0600742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0812  putative transmembrane fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 398 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0579  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 400 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  normal  0.245726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1709  fatty acid desaturase  25.71 
 
 		 393 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3890  fatty acid desaturase  27.43 
 
 		 393 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  27.64 
 
 		 403 aa  85.9  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5276  fatty acid desaturase  26.12 
 
 		 393 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5583  fatty acid desaturase  26.12 
 
 		 393 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  28.22 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0042  fatty acid desaturase  27.42 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  27.8 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  26.32 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  27.48 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03593  fatty acid desaturase  25.4 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2141  Fatty acid desaturase  26.16 
 
 		 389 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.623834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3182  fatty acid desaturase  26.86 
 
 		 404 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2641  Fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 398 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  29.02 
 
 		 404 aa  82  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3748  fatty acid desaturase  25.33 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  27.6 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0170  fatty acid desaturase family protein  24.08 
 
 		 446 aa  72.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.31 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  25.43 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  26.53 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  25.76 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  25.48 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  26.58 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  26.47 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  26.19 
 
 		 309 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  26.69 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21421  Fatty acid desaturase, type 1  26.19 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.661298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.04 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2192  stearoyl-CoA 9-desaturase  25.2 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  25.98 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.63 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.63 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  25.98 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  23.26 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18811  Fatty acid desaturase, type 1  26.72 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.52562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.78 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17991  Fatty acid desaturase, type 1  25.59 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  25.1 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.62 
 
 		 278 aa  62  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  23.79 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1907  stearoyl-CoA 9-desaturase  24.02 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>