159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4048 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4048  fatty acid desaturase  100 
 
 		 256 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295457  normal  0.0470616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1595  fatty acid desaturase (stearoyl-CoA desaturase)  54.84 
 
 		 253 aa  296  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0170967  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1136  fatty acid desaturase  54.36 
 
 		 248 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00601185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0451  fatty acid desaturase  52.02 
 
 		 248 aa  279  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3484  fatty acid desaturase  57.27 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3564  fatty acid desaturase  51.04 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392803  normal  0.531214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1354  fatty acid desaturase  49.6 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4336  fatty acid desaturase  49.58 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  hitchhiker  0.00142365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10163  fatty acid desaturase  44.72 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1686  fatty-acid desaturase  45.42 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.726488 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  31.17 
 
 		 395 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  29.92 
 
 		 396 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  29.92 
 
 		 396 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2450  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  28.74 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  31.36 
 
 		 384 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  31.36 
 
 		 384 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  30.12 
 
 		 404 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2642  Fatty acid desaturase  29.39 
 
 		 389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2775  Fatty acid desaturase  29.39 
 
 		 389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  29.32 
 
 		 399 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1828  fatty acid desaturase  31.76 
 
 		 389 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.665494  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  28.92 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  28.85 
 
 		 396 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2594  fatty acid desaturase  31.33 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583715  normal  0.31679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  27.24 
 
 		 412 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  28.4 
 
 		 399 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  30.09 
 
 		 394 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2141  Fatty acid desaturase  29.87 
 
 		 389 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.623834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3182  fatty acid desaturase  28.51 
 
 		 404 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  29.03 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0601  hypothetical protein  29.2 
 
 		 395 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0042  fatty acid desaturase  28.86 
 
 		 400 aa  99  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4308  fatty acid desaturase  29.96 
 
 		 396 aa  99  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  28.51 
 
 		 407 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  29.65 
 
 		 412 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0618  hypothetical protein  28.76 
 
 		 395 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  28.88 
 
 		 394 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3748  fatty acid desaturase  26.87 
 
 		 392 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2641  Fatty acid desaturase  28.45 
 
 		 398 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  27.95 
 
 		 403 aa  95.5  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  27.13 
 
 		 407 aa  95.5  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2532  fatty acid desaturase  27.71 
 
 		 398 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459452 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1896  fatty acid desaturase  27.71 
 
 		 398 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2507  fatty acid desaturase  27.71 
 
 		 398 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  28.51 
 
 		 404 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  27.95 
 
 		 403 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03593  fatty acid desaturase  28.96 
 
 		 405 aa  94.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2237  fatty acid desaturase family protein  27.31 
 
 		 398 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0317102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1130  fatty acid desaturase family protein  27.31 
 
 		 397 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0775  fatty acid desaturase family protein  26.51 
 
 		 397 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3432  fatty acid desaturase  28.35 
 
 		 404 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.820989  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2653  fatty acid desaturase family protein  27.31 
 
 		 398 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1028  fatty acid desaturase family protein  27.31 
 
 		 398 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0972  fatty acid desaturase family protein  27.31 
 
 		 397 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0976  fatty acid desaturase family protein  27.31 
 
 		 398 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2107  fatty acid desaturase family protein  27.31 
 
 		 397 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0788  fatty acid desaturase  26.91 
 
 		 397 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0567815  normal  0.0980312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5839  Fatty acid desaturase  26.91 
 
 		 397 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03730  putative fatty acid desaturase  28.88 
 
 		 392 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0377  putative fatty acid desaturase  28.88 
 
 		 392 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  27.52 
 
 		 407 aa  92.4  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3154  fatty acid desaturase  27.62 
 
 		 398 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357415  normal  0.0600742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2425  fatty acid desaturase  26.03 
 
 		 398 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0695745  hitchhiker  0.0000498345 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2554  fatty acid desaturase  26.03 
 
 		 398 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0579  fatty acid desaturase  26.51 
 
 		 400 aa  92  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  normal  0.245726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0812  putative transmembrane fatty acid desaturase  27.2 
 
 		 398 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1709  fatty acid desaturase  27.38 
 
 		 393 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3890  fatty acid desaturase  27.2 
 
 		 393 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0217  fatty acid desaturase  28.33 
 
 		 394 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0232  fatty acid desaturase  27.43 
 
 		 394 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  29.41 
 
 		 407 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0241  fatty acid desaturase  28.33 
 
 		 394 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4995  fatty acid desaturase  27.42 
 
 		 394 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.702334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5276  fatty acid desaturase  25.38 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5583  fatty acid desaturase  25.38 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.91 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1907  stearoyl-CoA 9-desaturase  27.38 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  27.84 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0170  fatty acid desaturase family protein  26.07 
 
 		 446 aa  75.5  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.85 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.24 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  27.41 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.82 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.74 
 
 		 272 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1607  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  25.37 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  25.29 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6429  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.87 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.79 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  25.88 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.62 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  28.22 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21421  Fatty acid desaturase, type 1  28.22 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.661298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5325  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  23.89 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  23.68 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18621  Fatty acid desaturase, type 1  26.77 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.702391  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4419  fatty acid desaturase  35.8 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  25.68 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  27.17 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  27.17 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2192  stearoyl-CoA 9-desaturase  25.3 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>