188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10163 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10163  fatty acid desaturase  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1136  fatty acid desaturase  57.08 
 
 
248 aa  299  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00601185  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4336  fatty acid desaturase  57.74 
 
 
251 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  hitchhiker  0.00142365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3564  fatty acid desaturase  52.7 
 
 
249 aa  266  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392803  normal  0.531214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1686  fatty-acid desaturase  48.96 
 
 
246 aa  256  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.726488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1595  fatty acid desaturase (stearoyl-CoA desaturase)  51.05 
 
 
253 aa  254  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0170967  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0451  fatty acid desaturase  50.2 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1354  fatty acid desaturase  48.98 
 
 
271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149217  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4048  fatty acid desaturase  44.72 
 
 
256 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295457  normal  0.0470616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3484  fatty acid desaturase  47.53 
 
 
244 aa  227  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2450  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  30.36 
 
 
398 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  32.76 
 
 
395 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  29.96 
 
 
396 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  29.96 
 
 
396 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  31.17 
 
 
404 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  30.12 
 
 
412 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  28.82 
 
 
384 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  28.82 
 
 
384 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2642  Fatty acid desaturase  28.51 
 
 
389 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2775  Fatty acid desaturase  28.51 
 
 
389 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0579  fatty acid desaturase  28.51 
 
 
400 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  normal  0.245726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  28.29 
 
 
396 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0775  fatty acid desaturase family protein  27.98 
 
 
397 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  29.32 
 
 
399 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2237  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 
398 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0317102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1130  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 
397 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2653  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 
398 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1028  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 
398 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0972  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 
397 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0976  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 
398 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2107  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 
397 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1828  fatty acid desaturase  27.27 
 
 
389 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.665494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2425  fatty acid desaturase  28.51 
 
 
398 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0695745  hitchhiker  0.0000498345 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2554  fatty acid desaturase  28.51 
 
 
398 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1709  fatty acid desaturase  28.74 
 
 
393 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230119  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0788  fatty acid desaturase  28.1 
 
 
397 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0567815  normal  0.0980312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5839  Fatty acid desaturase  28.51 
 
 
397 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  29.55 
 
 
399 aa  101  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  28.74 
 
 
397 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2641  Fatty acid desaturase  27.53 
 
 
398 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1896  fatty acid desaturase  28.69 
 
 
398 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2507  fatty acid desaturase  28.69 
 
 
398 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3432  fatty acid desaturase  29.08 
 
 
404 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.820989  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2532  fatty acid desaturase  28.69 
 
 
398 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0812  putative transmembrane fatty acid desaturase  26.86 
 
 
398 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3890  fatty acid desaturase  29.05 
 
 
393 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3154  fatty acid desaturase  28.32 
 
 
398 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357415  normal  0.0600742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  28.69 
 
 
403 aa  99.4  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  28.34 
 
 
399 aa  99.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0618  hypothetical protein  29.44 
 
 
395 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5276  fatty acid desaturase  28.22 
 
 
393 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5583  fatty acid desaturase  28.22 
 
 
393 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  29.79 
 
 
403 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0377  putative fatty acid desaturase  27.94 
 
 
392 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0601  hypothetical protein  29.44 
 
 
395 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03730  putative fatty acid desaturase  27.94 
 
 
392 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2594  fatty acid desaturase  29.49 
 
 
390 aa  96.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583715  normal  0.31679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0042  fatty acid desaturase  28.8 
 
 
400 aa  96.3  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931019 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2141  Fatty acid desaturase  29.87 
 
 
389 aa  95.5  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.623834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  27.13 
 
 
407 aa  95.5  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  28.74 
 
 
404 aa  95.5  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0241  fatty acid desaturase  27.07 
 
 
394 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  25.4 
 
 
394 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3182  fatty acid desaturase  28.29 
 
 
404 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4995  fatty acid desaturase  26.84 
 
 
394 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.702334  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0232  fatty acid desaturase  26.64 
 
 
394 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0217  fatty acid desaturase  26.64 
 
 
394 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  27.9 
 
 
407 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4308  fatty acid desaturase  28.14 
 
 
396 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  28.39 
 
 
407 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03593  fatty acid desaturase  28.21 
 
 
405 aa  89.7  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  28.05 
 
 
407 aa  89.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  25.91 
 
 
412 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3748  fatty acid desaturase  25.53 
 
 
392 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  24.9 
 
 
394 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0170  fatty acid desaturase family protein  28.11 
 
 
446 aa  85.9  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.24 
 
 
308 aa  85.5  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.11 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.61 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.88 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  24.89 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  26.45 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.81 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6429  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.08 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.24 
 
 
302 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.71 
 
 
274 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.71 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4419  fatty acid desaturase  43.21 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  25.2 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.53 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1482  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.09 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.59 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1607  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.84 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.92 
 
 
282 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.8 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4777  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.5 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321714 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  25.96 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  24.59 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2085  stearoyl-CoA 9-desaturase  40.48 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0129978 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>