259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2107 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0579  fatty acid desaturase  88.41 
 
 
400 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  normal  0.245726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3154  fatty acid desaturase  85.64 
 
 
398 aa  737    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357415  normal  0.0600742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2237  fatty acid desaturase family protein  99.75 
 
 
398 aa  824    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0317102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0972  fatty acid desaturase family protein  99.75 
 
 
397 aa  824    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0976  fatty acid desaturase family protein  99.75 
 
 
398 aa  824    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0788  fatty acid desaturase  90.43 
 
 
397 aa  759    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0567815  normal  0.0980312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2532  fatty acid desaturase  90.43 
 
 
398 aa  765    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1130  fatty acid desaturase family protein  100 
 
 
397 aa  825    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2653  fatty acid desaturase family protein  99.75 
 
 
398 aa  824    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5839  Fatty acid desaturase  89.17 
 
 
397 aa  753    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1028  fatty acid desaturase family protein  99.75 
 
 
398 aa  824    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0775  fatty acid desaturase family protein  97.23 
 
 
397 aa  810    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0812  putative transmembrane fatty acid desaturase  85.64 
 
 
398 aa  737    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1896  fatty acid desaturase  90.43 
 
 
398 aa  765    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2107  fatty acid desaturase family protein  100 
 
 
397 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2554  fatty acid desaturase  89.42 
 
 
398 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2507  fatty acid desaturase  90.43 
 
 
398 aa  765    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2425  fatty acid desaturase  89.92 
 
 
398 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0695745  hitchhiker  0.0000498345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2450  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  68.34 
 
 
398 aa  584  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  68.26 
 
 
396 aa  584  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  68.26 
 
 
396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2641  Fatty acid desaturase  69.47 
 
 
398 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  66.25 
 
 
396 aa  567  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  65.49 
 
 
412 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  63.45 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  61.68 
 
 
397 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1828  fatty acid desaturase  64.19 
 
 
389 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.665494  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3890  fatty acid desaturase  60.87 
 
 
393 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2594  fatty acid desaturase  58.97 
 
 
390 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583715  normal  0.31679 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2141  Fatty acid desaturase  59.59 
 
 
389 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.623834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  59.9 
 
 
407 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5276  fatty acid desaturase  59.08 
 
 
393 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5583  fatty acid desaturase  59.08 
 
 
393 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3432  fatty acid desaturase  58.02 
 
 
404 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.820989  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1709  fatty acid desaturase  58.82 
 
 
393 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230119  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  59.39 
 
 
407 aa  490  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  57.76 
 
 
403 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  57.51 
 
 
403 aa  488  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  58.23 
 
 
407 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  57.76 
 
 
399 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  56.6 
 
 
404 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3182  fatty acid desaturase  57.18 
 
 
404 aa  474  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  58.44 
 
 
399 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  56.09 
 
 
404 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2642  Fatty acid desaturase  54.24 
 
 
389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2775  Fatty acid desaturase  53.98 
 
 
389 aa  450  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4308  fatty acid desaturase  53.21 
 
 
396 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0377  putative fatty acid desaturase  53.98 
 
 
392 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03730  putative fatty acid desaturase  53.98 
 
 
392 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0217  fatty acid desaturase  52.96 
 
 
394 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0232  fatty acid desaturase  52.96 
 
 
394 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0241  fatty acid desaturase  52.96 
 
 
394 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  51.53 
 
 
394 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  51.93 
 
 
412 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4995  fatty acid desaturase  51.55 
 
 
394 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.702334  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  50.52 
 
 
394 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  50.64 
 
 
407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0618  hypothetical protein  49.87 
 
 
395 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0601  hypothetical protein  49.87 
 
 
395 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3748  fatty acid desaturase  50.26 
 
 
392 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0170  fatty acid desaturase family protein  50 
 
 
446 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  46.25 
 
 
384 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  46.25 
 
 
384 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03593  fatty acid desaturase  48.21 
 
 
405 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  46.65 
 
 
395 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0042  fatty acid desaturase  48.17 
 
 
400 aa  365  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4419  fatty acid desaturase  52.57 
 
 
273 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1595  fatty acid desaturase (stearoyl-CoA desaturase)  28.15 
 
 
253 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0170967  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10163  fatty acid desaturase  27.8 
 
 
246 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.13 
 
 
270 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.08 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.2 
 
 
285 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.89 
 
 
300 aa  96.3  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1354  fatty acid desaturase  26.86 
 
 
271 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149217  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  29.51 
 
 
306 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4048  fatty acid desaturase  27.31 
 
 
256 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295457  normal  0.0470616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3484  fatty acid desaturase  25.11 
 
 
244 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3564  fatty acid desaturase  26.45 
 
 
249 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392803  normal  0.531214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.69 
 
 
272 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4336  fatty acid desaturase  26.8 
 
 
251 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  hitchhiker  0.00142365 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.03 
 
 
303 aa  90.1  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  31.8 
 
 
358 aa  89.7  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.3 
 
 
280 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1136  fatty acid desaturase  25.5 
 
 
248 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00601185  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2192  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.96 
 
 
307 aa  87.4  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1686  fatty-acid desaturase  25.4 
 
 
246 aa  86.3  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.726488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0451  fatty acid desaturase  25.2 
 
 
248 aa  86.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.08 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.83 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.57 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.39 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.3 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.77 
 
 
274 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.77 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.22 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.64 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.87 
 
 
272 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  28.14 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  28.81 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4777  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.18 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>