174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1595 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1595  fatty acid desaturase (stearoyl-CoA desaturase)  100 
 
 		 253 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0170967  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1354  fatty acid desaturase  62.9 
 
 		 271 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0451  fatty acid desaturase  62.66 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1136  fatty acid desaturase  59.83 
 
 		 248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00601185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4048  fatty acid desaturase  54.84 
 
 		 256 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295457  normal  0.0470616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3484  fatty acid desaturase  59.39 
 
 		 244 aa  291  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3564  fatty acid desaturase  55.83 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392803  normal  0.531214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4336  fatty acid desaturase  53.94 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  hitchhiker  0.00142365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10163  fatty acid desaturase  51.05 
 
 		 246 aa  254  6e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1686  fatty-acid desaturase  47.28 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.726488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  32.02 
 
 		 396 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  32.02 
 
 		 396 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2450  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  32.02 
 
 		 398 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  30.28 
 
 		 394 aa  121  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  29.53 
 
 		 396 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2594  fatty acid desaturase  30.35 
 
 		 390 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583715  normal  0.31679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  29.8 
 
 		 412 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  29.92 
 
 		 412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  31.35 
 
 		 394 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2642  Fatty acid desaturase  30.8 
 
 		 389 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03730  putative fatty acid desaturase  29.3 
 
 		 392 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0377  putative fatty acid desaturase  29.3 
 
 		 392 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2775  Fatty acid desaturase  30.96 
 
 		 389 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  29.55 
 
 		 397 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1828  fatty acid desaturase  28 
 
 		 389 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.665494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0232  fatty acid desaturase  30.28 
 
 		 394 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  31.17 
 
 		 395 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  31.38 
 
 		 403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  31.8 
 
 		 403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  28.06 
 
 		 399 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0217  fatty acid desaturase  30.98 
 
 		 394 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4995  fatty acid desaturase  30.74 
 
 		 394 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.702334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5276  fatty acid desaturase  29.92 
 
 		 393 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5583  fatty acid desaturase  29.92 
 
 		 393 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0241  fatty acid desaturase  29.48 
 
 		 394 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1709  fatty acid desaturase  30.33 
 
 		 393 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  31.05 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2425  fatty acid desaturase  28.99 
 
 		 398 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0695745  hitchhiker  0.0000498345 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2554  fatty acid desaturase  28.99 
 
 		 398 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4308  fatty acid desaturase  28.63 
 
 		 396 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3432  fatty acid desaturase  29.48 
 
 		 404 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.820989  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5839  Fatty acid desaturase  27.73 
 
 		 397 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2141  Fatty acid desaturase  29.75 
 
 		 389 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.623834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0972  fatty acid desaturase family protein  28.15 
 
 		 397 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0579  fatty acid desaturase  26.77 
 
 		 400 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  normal  0.245726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2532  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459452 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1896  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2507  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  28.28 
 
 		 399 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  27.71 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2237  fatty acid desaturase family protein  28.15 
 
 		 398 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0317102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0788  fatty acid desaturase  28.15 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0567815  normal  0.0980312 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2653  fatty acid desaturase family protein  28.15 
 
 		 398 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  28.98 
 
 		 407 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1028  fatty acid desaturase family protein  28.15 
 
 		 398 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0976  fatty acid desaturase family protein  28.15 
 
 		 398 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3890  fatty acid desaturase  30.36 
 
 		 393 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1130  fatty acid desaturase family protein  28.15 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2107  fatty acid desaturase family protein  28.15 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0775  fatty acid desaturase family protein  27.31 
 
 		 397 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  29.17 
 
 		 399 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2641  Fatty acid desaturase  29.46 
 
 		 398 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3154  fatty acid desaturase  26.69 
 
 		 398 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357415  normal  0.0600742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  29.67 
 
 		 404 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  29.92 
 
 		 407 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0812  putative transmembrane fatty acid desaturase  26.69 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3748  fatty acid desaturase  28.51 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  26.34 
 
 		 384 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  26.34 
 
 		 384 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0601  hypothetical protein  29.65 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0618  hypothetical protein  29.91 
 
 		 395 aa  99.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0042  fatty acid desaturase  27.2 
 
 		 400 aa  99  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  26.19 
 
 		 407 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0170  fatty acid desaturase family protein  26.09 
 
 		 446 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3182  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 404 aa  92  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03593  fatty acid desaturase  25.93 
 
 		 405 aa  89.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  28.35 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.75 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.76 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.97 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.97 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  27.03 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  25.83 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.92 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  26.88 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.14 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  26.64 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  23.17 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  26.69 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  25.42 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.18 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  24.42 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01780  delta 9 acyl-lipid fatty acid desaturase  26.42 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1957  Stearoyl-CoA 9-desaturase  23.57 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0747957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.56 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1907  stearoyl-CoA 9-desaturase  22.96 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1482  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.98 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4419  fatty acid desaturase  41.67 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  24.31 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.36 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>