190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03593 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03593  fatty acid desaturase  100 
 
 
405 aa  823    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0042  fatty acid desaturase  79.32 
 
 
400 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2642  Fatty acid desaturase  49.1 
 
 
389 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2775  Fatty acid desaturase  48.98 
 
 
389 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0972  fatty acid desaturase family protein  47.97 
 
 
397 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2237  fatty acid desaturase family protein  47.97 
 
 
398 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0317102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1130  fatty acid desaturase family protein  47.97 
 
 
397 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2653  fatty acid desaturase family protein  47.97 
 
 
398 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1028  fatty acid desaturase family protein  47.97 
 
 
398 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0976  fatty acid desaturase family protein  47.97 
 
 
398 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2107  fatty acid desaturase family protein  47.97 
 
 
397 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0601  hypothetical protein  45.88 
 
 
395 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0775  fatty acid desaturase family protein  47.21 
 
 
397 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0618  hypothetical protein  45.22 
 
 
395 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2532  fatty acid desaturase  46.94 
 
 
398 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459452 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1896  fatty acid desaturase  46.94 
 
 
398 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2425  fatty acid desaturase  47.19 
 
 
398 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0695745  hitchhiker  0.0000498345 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2554  fatty acid desaturase  47.19 
 
 
398 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2507  fatty acid desaturase  46.94 
 
 
398 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5839  Fatty acid desaturase  46.17 
 
 
397 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0579  fatty acid desaturase  46.72 
 
 
400 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  normal  0.245726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0812  putative transmembrane fatty acid desaturase  45.69 
 
 
398 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0788  fatty acid desaturase  47.21 
 
 
397 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0567815  normal  0.0980312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3154  fatty acid desaturase  45.43 
 
 
398 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357415  normal  0.0600742 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  45.85 
 
 
384 aa  362  8e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  45.6 
 
 
384 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  45.66 
 
 
407 aa  358  9e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2594  fatty acid desaturase  45.32 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583715  normal  0.31679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  46.94 
 
 
407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  46.27 
 
 
403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  45.9 
 
 
403 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2141  Fatty acid desaturase  43.67 
 
 
389 aa  354  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.623834  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  46.33 
 
 
407 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  43.17 
 
 
396 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  44.5 
 
 
412 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2450  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  45.89 
 
 
398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  46.74 
 
 
407 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4308  fatty acid desaturase  44.1 
 
 
396 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  45.29 
 
 
404 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  43.19 
 
 
399 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  44.64 
 
 
396 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  44.64 
 
 
396 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0377  putative fatty acid desaturase  45.13 
 
 
392 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03730  putative fatty acid desaturase  45.13 
 
 
392 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3432  fatty acid desaturase  44.78 
 
 
404 aa  348  9e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.820989  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3748  fatty acid desaturase  44.62 
 
 
392 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4995  fatty acid desaturase  45.08 
 
 
394 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.702334  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0241  fatty acid desaturase  44.7 
 
 
394 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0217  fatty acid desaturase  44.7 
 
 
394 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  44.53 
 
 
394 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0232  fatty acid desaturase  44.7 
 
 
394 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  45.66 
 
 
404 aa  342  8e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  44.22 
 
 
394 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  44.44 
 
 
412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3182  fatty acid desaturase  44.42 
 
 
404 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3890  fatty acid desaturase  47.73 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  44.15 
 
 
399 aa  336  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1828  fatty acid desaturase  45.13 
 
 
389 aa  335  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.665494  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  43.59 
 
 
395 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1709  fatty acid desaturase  46.72 
 
 
393 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230119  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2641  Fatty acid desaturase  44.22 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114027 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  40.31 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  40.2 
 
 
399 aa  318  7e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0170  fatty acid desaturase family protein  44.13 
 
 
446 aa  315  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5276  fatty acid desaturase  43.78 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5583  fatty acid desaturase  43.78 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4419  fatty acid desaturase  41.22 
 
 
273 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4336  fatty acid desaturase  30.08 
 
 
251 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  hitchhiker  0.00142365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4048  fatty acid desaturase  28.96 
 
 
256 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295457  normal  0.0470616 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.91 
 
 
270 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10163  fatty acid desaturase  29.15 
 
 
246 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1595  fatty acid desaturase (stearoyl-CoA desaturase)  26.75 
 
 
253 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0170967  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.4 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0451  fatty acid desaturase  28 
 
 
248 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.91 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.46 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.33 
 
 
280 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.01 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.25 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1354  fatty acid desaturase  27.63 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149217  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1136  fatty acid desaturase  25.4 
 
 
248 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00601185  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3564  fatty acid desaturase  25.81 
 
 
249 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392803  normal  0.531214 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  26.54 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.53 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.29 
 
 
272 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.08 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.1 
 
 
300 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.41 
 
 
278 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.57 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.38 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  30.65 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.46 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.69 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  30.65 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18811  Fatty acid desaturase, type 1  30.24 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.52562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4777  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.46 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.34 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4990  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.16 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  28.16 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  26.58 
 
 
309 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>