197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3386 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  73.95 
 
 
404 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  99.26 
 
 
403 aa  820    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  75 
 
 
399 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  79.1 
 
 
407 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3432  fatty acid desaturase  84.33 
 
 
404 aa  718    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.820989  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  100 
 
 
403 aa  823    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  78 
 
 
404 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  73.64 
 
 
399 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3182  fatty acid desaturase  70.97 
 
 
404 aa  615  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  66.58 
 
 
407 aa  578  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  65.5 
 
 
407 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  63.78 
 
 
396 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  63.78 
 
 
396 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  62.59 
 
 
412 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2450  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  63.01 
 
 
398 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  64.12 
 
 
396 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  59.28 
 
 
397 aa  505  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  57.87 
 
 
399 aa  495  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2237  fatty acid desaturase family protein  57.76 
 
 
398 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0317102  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0976  fatty acid desaturase family protein  57.76 
 
 
398 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1130  fatty acid desaturase family protein  57.76 
 
 
397 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2107  fatty acid desaturase family protein  57.76 
 
 
397 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0775  fatty acid desaturase family protein  57.51 
 
 
397 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2653  fatty acid desaturase family protein  57.76 
 
 
398 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1028  fatty acid desaturase family protein  57.76 
 
 
398 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0972  fatty acid desaturase family protein  57.76 
 
 
397 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5839  Fatty acid desaturase  57.14 
 
 
397 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0579  fatty acid desaturase  57.25 
 
 
400 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  normal  0.245726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1896  fatty acid desaturase  56.49 
 
 
398 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2532  fatty acid desaturase  56.49 
 
 
398 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0788  fatty acid desaturase  57.65 
 
 
397 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0567815  normal  0.0980312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2554  fatty acid desaturase  56.49 
 
 
398 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2507  fatty acid desaturase  56.49 
 
 
398 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2425  fatty acid desaturase  56.49 
 
 
398 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0695745  hitchhiker  0.0000498345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3154  fatty acid desaturase  56.74 
 
 
398 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357415  normal  0.0600742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0812  putative transmembrane fatty acid desaturase  56.23 
 
 
398 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2141  Fatty acid desaturase  57.03 
 
 
389 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.623834  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2594  fatty acid desaturase  56.81 
 
 
390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583715  normal  0.31679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1828  fatty acid desaturase  58.66 
 
 
389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.665494  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2641  Fatty acid desaturase  55.58 
 
 
398 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2642  Fatty acid desaturase  52.48 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2775  Fatty acid desaturase  52.22 
 
 
389 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3890  fatty acid desaturase  53.54 
 
 
393 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1709  fatty acid desaturase  52.67 
 
 
393 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230119  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5276  fatty acid desaturase  51.77 
 
 
393 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5583  fatty acid desaturase  51.77 
 
 
393 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4308  fatty acid desaturase  51.56 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0377  putative fatty acid desaturase  53.12 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0618  hypothetical protein  50.39 
 
 
395 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0601  hypothetical protein  50.39 
 
 
395 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  52.09 
 
 
407 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03730  putative fatty acid desaturase  53.12 
 
 
392 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0217  fatty acid desaturase  51.3 
 
 
394 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0241  fatty acid desaturase  50.9 
 
 
394 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  50.26 
 
 
412 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  50.13 
 
 
394 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0232  fatty acid desaturase  50.9 
 
 
394 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4995  fatty acid desaturase  51.16 
 
 
394 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.702334  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  49.35 
 
 
394 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  48.34 
 
 
395 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  47.29 
 
 
384 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  47.29 
 
 
384 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0170  fatty acid desaturase family protein  50.52 
 
 
446 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3748  fatty acid desaturase  48.83 
 
 
392 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03593  fatty acid desaturase  46.13 
 
 
405 aa  354  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0042  fatty acid desaturase  48.01 
 
 
400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4419  fatty acid desaturase  47.64 
 
 
273 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1595  fatty acid desaturase (stearoyl-CoA desaturase)  31.38 
 
 
253 aa  113  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0170967  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3564  fatty acid desaturase  27.76 
 
 
249 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392803  normal  0.531214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1354  fatty acid desaturase  27.21 
 
 
271 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149217  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10163  fatty acid desaturase  28.69 
 
 
246 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4048  fatty acid desaturase  27.95 
 
 
256 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295457  normal  0.0470616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0451  fatty acid desaturase  26.21 
 
 
248 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  30.7 
 
 
306 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.29 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4336  fatty acid desaturase  26 
 
 
251 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  hitchhiker  0.00142365 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.46 
 
 
300 aa  90.9  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1136  fatty acid desaturase  28.05 
 
 
248 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00601185  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  36.6 
 
 
282 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  35.64 
 
 
285 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.74 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1686  fatty-acid desaturase  24.6 
 
 
246 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.726488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.69 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3484  fatty acid desaturase  25.83 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.48 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16070  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.62 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.49 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.41 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.98 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0909  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.26 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32330  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.26 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  25.56 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2261  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.26 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0125553  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  26.45 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  28.03 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.03 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0660  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.93 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0932  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.14 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  26.55 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.43 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>