197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0660 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0660  Stearoyl-CoA 9-desaturase  100 
 
 		 329 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32330  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  68.65 
 
 		 317 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16070  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  69.28 
 
 		 318 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0909  Stearoyl-CoA 9-desaturase  67.11 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0413  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  64.92 
 
 		 316 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0932  Stearoyl-CoA 9-desaturase  58.75 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3991  Stearoyl-CoA 9-desaturase  61.66 
 
 		 320 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0995  Stearoyl-CoA 9-desaturase  65.67 
 
 		 315 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0167  Stearoyl-CoA 9-desaturase  56.01 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3156  Stearoyl-CoA 9-desaturase  60.54 
 
 		 312 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1959  Stearoyl-CoA 9-desaturase  56.47 
 
 		 323 aa  358  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000202023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4191  stearoyl-CoA 9-desaturase  60.34 
 
 		 402 aa  358  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0555236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  56.29 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  53.8 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8609  Stearoyl-CoA 9-desaturase  58.71 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2615  Stearoyl-CoA 9-desaturase  57.4 
 
 		 311 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2261  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  58.08 
 
 		 302 aa  320  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0125553  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8743  Stearoyl-CoA 9-desaturase  54.14 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4990  Stearoyl-CoA 9-desaturase  47.52 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4186  Stearoyl-CoA 9-desaturase  46.49 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  45.14 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  43.75 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1607  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  43.66 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2938  stearoyl-CoA 9-desaturase  47.22 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  45.82 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1907  stearoyl-CoA 9-desaturase  37.66 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  40.6 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1156  JamB  38.34 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2784  fatty acid desaturase family protein  38.34 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2938  fatty acid desaturase family protein  39.79 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0281  JamB  39.79 
 
 		 344 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0278  JamB  41.83 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2941  Fatty-acid desaturase  42.63 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1159  JamB  43.03 
 
 		 346 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2787  fatty acid desaturase family protein  43.03 
 
 		 346 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01915  putative fatty acid desaturase transmembrane protein  38.77 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.373893  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  37.04 
 
 		 272 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  36.82 
 
 		 294 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  37.26 
 
 		 270 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  36.06 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17991  Fatty acid desaturase, type 1  34.02 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  36.52 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2865  stearoyl-CoA 9-desaturase  36.15 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18811  Fatty acid desaturase, type 1  37.1 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.52562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4777  Stearoyl-CoA 9-desaturase  36.43 
 
 		 284 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321714 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  35 
 
 		 358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  37.1 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.21 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28951  Fatty acid desaturase, type 1  33.12 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  36.75 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  36.12 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.21 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  35.14 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4032  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.2 
 
 		 375 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0694156  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18621  Fatty acid desaturase, type 1  33.81 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.702391  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.88 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1612  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.56 
 
 		 379 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.08 
 
 		 272 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.61 
 
 		 282 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  33.33 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2192  stearoyl-CoA 9-desaturase  32.98 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.8 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.85 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01180  stearoyl-CoA 9-desaturase, putative  30.42 
 
 		 594 aa  139  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443597  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21421  Fatty acid desaturase, type 1  36.48 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.661298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.27 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03581  hypothetical putative delta-9 fatty acid desaturase  29.97 
 
 		 375 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1023  fatty acid desaturase family proteiin  31.47 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1153  acyl-CoA desaturase  31.47 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.881632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  31.82 
 
 		 285 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6429  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.06 
 
 		 325 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70693  stearoyl-CoA desaturase  30.83 
 
 		 484 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1365  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.88 
 
 		 467 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000311769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.34 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0999  stearoyl-CoA 9-desaturase  33.47 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1267  stearoyl-CoA 9-desaturase  33.74 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000517428  normal  0.105516 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06731  Stearic acid desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJU5]  28.52 
 
 		 455 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04135  conserved hypothetical protein  31.1 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513143  normal  0.101908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0123  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.53 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00541017  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.54 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.0270833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0229  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.83 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000388622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0136  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.76 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0276259  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06094  acyl-CoA desaturase  28.28 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3542  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.62 
 
 		 368 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0592044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0176  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.51 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.482981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0174  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.47 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.18166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0178  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.47 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0621895  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4079  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.47 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0467069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4181  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.47 
 
 		 368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00992802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0197  fatty acid desaturase family proteiin  29.43 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1957  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.38 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0747957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.18 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0177  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.83 
 
 		 375 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1494  stearoyl-CoA 9-desaturase  27.54 
 
 		 372 aa  119  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.190826  normal  0.0846838 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0424  putative fatty acid desaturase  29.61 
 
 		 375 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0191  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.57 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195435  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4340  stearoyl-CoA 9-desaturase  27.33 
 
 		 372 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000789253  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2221  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.14 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.309276  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4712  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.14 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0146517  normal  0.30618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2131  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.79 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>