192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2261 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2261  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  100 
 
 
302 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0125553  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4191  stearoyl-CoA 9-desaturase  71.23 
 
 
402 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0555236  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0413  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  65.99 
 
 
316 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3156  Stearoyl-CoA 9-desaturase  61.09 
 
 
312 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0167  Stearoyl-CoA 9-desaturase  59.79 
 
 
321 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1959  Stearoyl-CoA 9-desaturase  63.07 
 
 
323 aa  364  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000202023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3991  Stearoyl-CoA 9-desaturase  61.59 
 
 
320 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2615  Stearoyl-CoA 9-desaturase  67.64 
 
 
311 aa  362  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26771  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0995  Stearoyl-CoA 9-desaturase  66.32 
 
 
315 aa  359  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16070  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  57.29 
 
 
318 aa  350  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8609  Stearoyl-CoA 9-desaturase  61.69 
 
 
313 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0660  Stearoyl-CoA 9-desaturase  58.08 
 
 
329 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0932  Stearoyl-CoA 9-desaturase  56.51 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32330  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  57.44 
 
 
317 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0909  Stearoyl-CoA 9-desaturase  58.33 
 
 
329 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8743  Stearoyl-CoA 9-desaturase  60.14 
 
 
364 aa  331  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  57.14 
 
 
377 aa  330  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  55.86 
 
 
339 aa  322  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4990  Stearoyl-CoA 9-desaturase  48.62 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4186  Stearoyl-CoA 9-desaturase  48.8 
 
 
303 aa  238  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1907  stearoyl-CoA 9-desaturase  44.63 
 
 
334 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  42.8 
 
 
312 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1607  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  42.4 
 
 
338 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2938  stearoyl-CoA 9-desaturase  46.8 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0213661  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1156  JamB  39.59 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  38.77 
 
 
294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2784  fatty acid desaturase family protein  39.59 
 
 
336 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2938  fatty acid desaturase family protein  39.59 
 
 
303 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0281  JamB  38.91 
 
 
344 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  42.26 
 
 
321 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  38.65 
 
 
305 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_003296  RS01915  putative fatty acid desaturase transmembrane protein  39.22 
 
 
301 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.373893  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.15 
 
 
270 aa  158  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0278  JamB  39.16 
 
 
346 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28951  Fatty acid desaturase, type 1  37.91 
 
 
321 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.94 
 
 
272 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2192  stearoyl-CoA 9-desaturase  35.64 
 
 
307 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.7 
 
 
272 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.7 
 
 
278 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  33.45 
 
 
272 aa  149  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6429  Stearoyl-CoA 9-desaturase  36 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.11 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.76 
 
 
274 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.45 
 
 
272 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17991  Fatty acid desaturase, type 1  36.21 
 
 
314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2941  Fatty-acid desaturase  38.78 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1159  JamB  38.78 
 
 
346 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2787  fatty acid desaturase family protein  38.78 
 
 
346 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  35.25 
 
 
306 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  34.88 
 
 
300 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  35.25 
 
 
303 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18621  Fatty acid desaturase, type 1  32.85 
 
 
328 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.702391  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  32.65 
 
 
358 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2865  stearoyl-CoA 9-desaturase  34.53 
 
 
393 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18811  Fatty acid desaturase, type 1  32.49 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.52562  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  32.62 
 
 
309 aa  138  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.13 
 
 
280 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21421  Fatty acid desaturase, type 1  34.82 
 
 
259 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.661298  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1153  acyl-CoA desaturase  29.9 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.881632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1023  fatty acid desaturase family proteiin  29.9 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  32.49 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  32.13 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.94 
 
 
302 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1267  stearoyl-CoA 9-desaturase  34.06 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000517428  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01180  stearoyl-CoA 9-desaturase, putative  31.52 
 
 
594 aa  132  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443597  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06094  acyl-CoA desaturase  30.86 
 
 
374 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4777  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.68 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4032  stearoyl-CoA 9-desaturase  26.8 
 
 
375 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0694156  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.49 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.29 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0197  fatty acid desaturase family proteiin  29.17 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03581  hypothetical putative delta-9 fatty acid desaturase  29.43 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.31 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04135  conserved hypothetical protein  29.31 
 
 
449 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513143  normal  0.101908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.67 
 
 
308 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1365  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32 
 
 
467 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000311769  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70693  stearoyl-CoA desaturase  29.69 
 
 
484 aa  125  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441188  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06731  Stearic acid desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJU5]  30.69 
 
 
455 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0174  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.04 
 
 
368 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.18166  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0999  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.27 
 
 
467 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0178  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.04 
 
 
368 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0621895  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4079  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.04 
 
 
368 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0467069  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4181  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.04 
 
 
368 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00992802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3542  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.21 
 
 
368 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0592044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0177  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.07 
 
 
375 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.99 
 
 
285 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.72 
 
 
375 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.0270833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0176  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.72 
 
 
375 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.482981  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1494  stearoyl-CoA 9-desaturase  27.15 
 
 
372 aa  122  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.190826  normal  0.0846838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1612  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.53 
 
 
379 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0123  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.84 
 
 
369 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00541017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0136  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.08 
 
 
368 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0276259  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0229  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.43 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000388622  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0424  putative fatty acid desaturase  29.07 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4340  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.91 
 
 
372 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000789253  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2221  Stearoyl-CoA 9-desaturase  38.17 
 
 
287 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.309276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2131  Stearoyl-CoA 9-desaturase  39.02 
 
 
287 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1717  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  38.32 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.534578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4712  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.12 
 
 
368 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0146517  normal  0.30618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0191  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.52 
 
 
372 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195435  normal  0.0791415 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>