179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0176 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0197  fatty acid desaturase family proteiin  93.75 
 
 
368 aa  702    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0174  stearoyl-CoA 9-desaturase  89.4 
 
 
368 aa  678    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.18166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0176  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  100 
 
 
375 aa  774    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.482981  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  98.4 
 
 
375 aa  763    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.0270833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4079  Stearoyl-CoA 9-desaturase  89.4 
 
 
368 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0467069  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0177  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  97.87 
 
 
375 aa  739    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4181  stearoyl-CoA 9-desaturase  89.13 
 
 
368 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00992802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0178  stearoyl-CoA 9-desaturase  89.4 
 
 
368 aa  679    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0621895  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3542  stearoyl-CoA 9-desaturase  89.13 
 
 
368 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0592044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0123  stearoyl-CoA 9-desaturase  79.35 
 
 
369 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00541017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0229  stearoyl-CoA 9-desaturase  79.29 
 
 
368 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000388622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0136  stearoyl-CoA 9-desaturase  76.9 
 
 
368 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0276259  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4712  stearoyl-CoA 9-desaturase  78.26 
 
 
368 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0146517  normal  0.30618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0162  stearoyl-CoA 9-desaturase  79.19 
 
 
378 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000759757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4340  stearoyl-CoA 9-desaturase  77.45 
 
 
372 aa  599  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000789253  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0191  stearoyl-CoA 9-desaturase  74.05 
 
 
372 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195435  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0424  putative fatty acid desaturase  59.46 
 
 
375 aa  467  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1494  stearoyl-CoA 9-desaturase  59.41 
 
 
372 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.190826  normal  0.0846838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4032  stearoyl-CoA 9-desaturase  56.95 
 
 
375 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0694156  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06094  acyl-CoA desaturase  56.99 
 
 
374 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03581  hypothetical putative delta-9 fatty acid desaturase  56.91 
 
 
375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000292  delta-9 fatty acid desaturase  58.36 
 
 
329 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1612  Stearoyl-CoA 9-desaturase  53.47 
 
 
379 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1267  stearoyl-CoA 9-desaturase  46.21 
 
 
396 aa  352  5e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000517428  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0999  stearoyl-CoA 9-desaturase  47.93 
 
 
467 aa  348  7e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1365  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  44.92 
 
 
467 aa  347  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000311769  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1153  acyl-CoA desaturase  42.58 
 
 
371 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.881632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1023  fatty acid desaturase family proteiin  42.58 
 
 
371 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01180  stearoyl-CoA 9-desaturase, putative  41.67 
 
 
594 aa  236  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443597  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2865  stearoyl-CoA 9-desaturase  40.95 
 
 
393 aa  232  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70693  stearoyl-CoA desaturase  42.86 
 
 
484 aa  228  9e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441188  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06731  Stearic acid desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJU5]  42.16 
 
 
455 aa  220  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04135  conserved hypothetical protein  46.34 
 
 
449 aa  212  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513143  normal  0.101908 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.06 
 
 
280 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  36.14 
 
 
282 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.41 
 
 
285 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.14 
 
 
302 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.44 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.05 
 
 
272 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  35.97 
 
 
358 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.62 
 
 
270 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.22 
 
 
272 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  30 
 
 
272 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4990  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.06 
 
 
307 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4777  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.86 
 
 
284 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.74 
 
 
272 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28797  desaturase delta 9 desaturase  38.4 
 
 
333 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1156  JamB  34.14 
 
 
344 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2784  fatty acid desaturase family protein  34.14 
 
 
336 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1607  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  35.27 
 
 
338 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2938  fatty acid desaturase family protein  34.14 
 
 
303 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.19 
 
 
274 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.93 
 
 
294 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.19 
 
 
274 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.22 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.52 
 
 
339 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0167  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.47 
 
 
321 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0281  JamB  32.53 
 
 
344 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.1 
 
 
377 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6429  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.76 
 
 
325 aa  136  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17991  Fatty acid desaturase, type 1  37 
 
 
314 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01780  delta 9 acyl-lipid fatty acid desaturase  37.19 
 
 
309 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1907  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.34 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48736  stearoyl-CoA desaturase  29.45 
 
 
508 aa  133  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.154814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1959  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30 
 
 
323 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000202023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.45 
 
 
294 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  34.51 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  34.43 
 
 
309 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2192  stearoyl-CoA 9-desaturase  35.43 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  34.51 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2615  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.86 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26771  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18811  Fatty acid desaturase, type 1  33.63 
 
 
312 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.52562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18621  Fatty acid desaturase, type 1  33.78 
 
 
328 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.702391  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32330  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  31.95 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.19 
 
 
278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  31.79 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21421  Fatty acid desaturase, type 1  33.75 
 
 
259 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.661298  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  32.67 
 
 
306 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.35 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4191  stearoyl-CoA 9-desaturase  32.16 
 
 
402 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0555236  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.02 
 
 
303 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4186  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.92 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16070  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.82 
 
 
318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0413  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.08 
 
 
316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2221  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.58 
 
 
287 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.309276  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3991  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.33 
 
 
320 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2131  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.58 
 
 
287 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28951  Fatty acid desaturase, type 1  35.87 
 
 
321 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  33.2 
 
 
300 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  32.95 
 
 
305 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2938  stearoyl-CoA 9-desaturase  33.33 
 
 
295 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0213661  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1957  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.67 
 
 
316 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0747957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0660  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.29 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3156  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.18 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2261  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.21 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0125553  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8743  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.46 
 
 
364 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1717  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.75 
 
 
287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.534578  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0932  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.52 
 
 
331 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0995  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.2 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8609  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.3 
 
 
313 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>