171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4032 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4032  stearoyl-CoA 9-desaturase  100 
 
 
375 aa  782    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0694156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03581  hypothetical putative delta-9 fatty acid desaturase  70.13 
 
 
375 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0229  stearoyl-CoA 9-desaturase  59.95 
 
 
368 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000388622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1494  stearoyl-CoA 9-desaturase  59.07 
 
 
372 aa  461  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.190826  normal  0.0846838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4079  Stearoyl-CoA 9-desaturase  62.57 
 
 
368 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0467069  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0178  stearoyl-CoA 9-desaturase  62.57 
 
 
368 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0621895  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  61.68 
 
 
375 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.0270833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0123  stearoyl-CoA 9-desaturase  58.92 
 
 
369 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00541017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0136  stearoyl-CoA 9-desaturase  58.58 
 
 
368 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0276259  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0174  stearoyl-CoA 9-desaturase  62.57 
 
 
368 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.18166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0177  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  60.78 
 
 
375 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4181  stearoyl-CoA 9-desaturase  62.28 
 
 
368 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00992802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3542  stearoyl-CoA 9-desaturase  61.38 
 
 
368 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0592044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0197  fatty acid desaturase family proteiin  60.18 
 
 
368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0176  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  60.48 
 
 
375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.482981  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0191  stearoyl-CoA 9-desaturase  59.89 
 
 
372 aa  448  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195435  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4712  stearoyl-CoA 9-desaturase  58.6 
 
 
368 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0146517  normal  0.30618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4340  stearoyl-CoA 9-desaturase  57.77 
 
 
372 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000789253  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0424  putative fatty acid desaturase  54.37 
 
 
375 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0162  stearoyl-CoA 9-desaturase  57.22 
 
 
378 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000759757  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06094  acyl-CoA desaturase  51.93 
 
 
374 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000292  delta-9 fatty acid desaturase  56.47 
 
 
329 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1612  Stearoyl-CoA 9-desaturase  50.54 
 
 
379 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0999  stearoyl-CoA 9-desaturase  46.59 
 
 
467 aa  325  7e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1365  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  46.38 
 
 
467 aa  324  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000311769  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1267  stearoyl-CoA 9-desaturase  46.69 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000517428  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2865  stearoyl-CoA 9-desaturase  42.94 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1023  fatty acid desaturase family proteiin  42.37 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1153  acyl-CoA desaturase  42.37 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.881632  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01180  stearoyl-CoA 9-desaturase, putative  41.81 
 
 
594 aa  236  6e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443597  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70693  stearoyl-CoA desaturase  44.4 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441188  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06731  Stearic acid desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJU5]  42.25 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04135  conserved hypothetical protein  41.38 
 
 
449 aa  206  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513143  normal  0.101908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.35 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  33.11 
 
 
358 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.7 
 
 
272 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.39 
 
 
280 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32330  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.3 
 
 
317 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.6 
 
 
272 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.74 
 
 
282 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.06 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4777  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.13 
 
 
284 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4990  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.33 
 
 
307 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.51 
 
 
285 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  31.43 
 
 
272 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.85 
 
 
274 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.85 
 
 
274 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.16 
 
 
272 aa  146  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.25 
 
 
302 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2615  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.74 
 
 
311 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26771  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.77 
 
 
270 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0660  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.2 
 
 
329 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3156  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.86 
 
 
312 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16070  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.42 
 
 
318 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4186  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.68 
 
 
303 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1959  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.88 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000202023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0167  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.58 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0413  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.45 
 
 
316 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470867  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18621  Fatty acid desaturase, type 1  33.45 
 
 
328 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.702391  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28797  desaturase delta 9 desaturase  32.38 
 
 
333 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  27.87 
 
 
339 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  32.95 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18811  Fatty acid desaturase, type 1  31.95 
 
 
312 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.52562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3991  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.58 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  32.61 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  34.09 
 
 
300 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.44 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.97 
 
 
321 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.25 
 
 
303 aa  133  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  27.27 
 
 
377 aa  133  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  31.84 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4191  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.57 
 
 
402 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0555236  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48736  stearoyl-CoA desaturase  27.46 
 
 
508 aa  132  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.154814 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  32.79 
 
 
306 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1607  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  31.02 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17991  Fatty acid desaturase, type 1  31.85 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2938  fatty acid desaturase family protein  31.48 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6429  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.73 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1156  JamB  31.97 
 
 
344 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2784  fatty acid desaturase family protein  31.97 
 
 
336 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2192  stearoyl-CoA 9-desaturase  32.59 
 
 
307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.94 
 
 
294 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0932  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.28 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  29.94 
 
 
305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0995  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.87 
 
 
315 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28951  Fatty acid desaturase, type 1  30.53 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1717  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.59 
 
 
287 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.534578  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  34.38 
 
 
309 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0281  JamB  30.61 
 
 
344 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2131  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.06 
 
 
287 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2261  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.32 
 
 
302 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0125553  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.67 
 
 
330 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2221  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.06 
 
 
287 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.309276  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21421  Fatty acid desaturase, type 1  34.38 
 
 
259 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.661298  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1957  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.98 
 
 
316 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0747957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8743  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.33 
 
 
364 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8609  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.63 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2938  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.7 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0213661  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01780  delta 9 acyl-lipid fatty acid desaturase  31.05 
 
 
309 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0909  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.87 
 
 
329 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>