195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3312 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  100 
 
 		 308 aa  637    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1717  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  45.67 
 
 		 287 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.534578  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6429  Stearoyl-CoA 9-desaturase  50.2 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2221  Stearoyl-CoA 9-desaturase  45.33 
 
 		 287 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.309276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2131  Stearoyl-CoA 9-desaturase  45.33 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2085  stearoyl-CoA 9-desaturase  46.52 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01780  delta 9 acyl-lipid fatty acid desaturase  41.7 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1957  Stearoyl-CoA 9-desaturase  43.07 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0747957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1482  stearoyl-CoA 9-desaturase  43.51 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5325  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  37.41 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0229  stearoyl-CoA 9-desaturase  33.7 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000388622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0123  stearoyl-CoA 9-desaturase  32.65 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00541017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3542  stearoyl-CoA 9-desaturase  32.88 
 
 		 368 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0592044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0191  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.83 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195435  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0136  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.09 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0276259  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0174  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.45 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.18166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4079  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.45 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0467069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1494  stearoyl-CoA 9-desaturase  33.44 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.190826  normal  0.0846838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0178  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.45 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0621895  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4181  stearoyl-CoA 9-desaturase  32 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00992802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0176  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.44 
 
 		 375 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.482981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0177  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.78 
 
 		 375 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4340  stearoyl-CoA 9-desaturase  34.62 
 
 		 372 aa  155  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000789253  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.44 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.0270833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0197  fatty acid desaturase family proteiin  32.06 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0424  putative fatty acid desaturase  30.66 
 
 		 375 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4032  stearoyl-CoA 9-desaturase  32.06 
 
 		 375 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0694156  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.06 
 
 		 272 aa  149  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.71 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0162  stearoyl-CoA 9-desaturase  34.05 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000759757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4712  stearoyl-CoA 9-desaturase  32.81 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0146517  normal  0.30618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.88 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18811  Fatty acid desaturase, type 1  33.96 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.52562  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  34.57 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  35.85 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03581  hypothetical putative delta-9 fatty acid desaturase  35.42 
 
 		 375 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  33.97 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06094  acyl-CoA desaturase  33.33 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.26 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  28.78 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4990  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.05 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.28 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000292  delta-9 fatty acid desaturase  32.68 
 
 		 329 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.62 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4777  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.5 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  31.62 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.63 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  32.47 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.9 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  36.86 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.92 
 
 		 272 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18621  Fatty acid desaturase, type 1  32.25 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.702391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21421  Fatty acid desaturase, type 1  34.47 
 
 		 259 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.661298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.63 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.33 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17991  Fatty acid desaturase, type 1  34.14 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70693  stearoyl-CoA desaturase  29.49 
 
 		 484 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1612  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.99 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2615  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.4 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.05 
 
 		 377 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.6 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.6 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28951  Fatty acid desaturase, type 1  34.59 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  34.96 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01180  stearoyl-CoA 9-desaturase, putative  30.11 
 
 		 594 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2192  stearoyl-CoA 9-desaturase  33.33 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  31.94 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  32.67 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2938  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.67 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.91 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04135  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 		 449 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513143  normal  0.101908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1907  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.89 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2261  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.67 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0125553  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16070  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.8 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3156  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.8 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4186  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.39 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1959  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.52 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000202023  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0413  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.43 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1153  acyl-CoA desaturase  29.17 
 
 		 371 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.881632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1023  fatty acid desaturase family proteiin  29.17 
 
 		 371 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1267  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.66 
 
 		 396 aa  122  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000517428  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0999  stearoyl-CoA 9-desaturase  32.68 
 
 		 467 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0932  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.46 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1365  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.3 
 
 		 467 aa  119  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000311769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0660  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.18 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  30.48 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0167  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.34 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8743  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.25 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.8 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3991  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.36 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8609  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.5 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0278  JamB  29.33 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0995  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.35 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2938  fatty acid desaturase family protein  28.4 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1156  JamB  28.4 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2784  fatty acid desaturase family protein  28.4 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4191  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.76 
 
 		 402 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0555236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0281  JamB  29.02 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1607  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.5 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2865  stearoyl-CoA 9-desaturase  32.1 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>