269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4308 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0217  fatty acid desaturase  84.52 
 
 		 394 aa  710    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4995  fatty acid desaturase  83.5 
 
 		 394 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.702334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0232  fatty acid desaturase  84.52 
 
 		 394 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  86.8 
 
 		 412 aa  723    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0241  fatty acid desaturase  83.5 
 
 		 394 aa  702    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  86.29 
 
 		 394 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  75.63 
 
 		 407 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  84.99 
 
 		 394 aa  706    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4308  fatty acid desaturase  100 
 
 		 396 aa  818    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0377  putative fatty acid desaturase  87.76 
 
 		 392 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03730  putative fatty acid desaturase  87.5 
 
 		 392 aa  726    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3748  fatty acid desaturase  61.07 
 
 		 392 aa  508  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2107  fatty acid desaturase family protein  53.21 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0976  fatty acid desaturase family protein  53.21 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2237  fatty acid desaturase family protein  53.21 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0317102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2653  fatty acid desaturase family protein  53.21 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1130  fatty acid desaturase family protein  53.21 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0972  fatty acid desaturase family protein  53.21 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0775  fatty acid desaturase family protein  53.21 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1028  fatty acid desaturase family protein  53.21 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0618  hypothetical protein  52.99 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0601  hypothetical protein  53.25 
 
 		 395 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  52.58 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  52.99 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2425  fatty acid desaturase  52.19 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0695745  hitchhiker  0.0000498345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0579  fatty acid desaturase  52.7 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  normal  0.245726 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5839  Fatty acid desaturase  52.06 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0812  putative transmembrane fatty acid desaturase  51.93 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2532  fatty acid desaturase  52.19 
 
 		 398 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459452 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1896  fatty acid desaturase  52.19 
 
 		 398 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2554  fatty acid desaturase  52.19 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2507  fatty acid desaturase  52.19 
 
 		 398 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3154  fatty acid desaturase  51.93 
 
 		 398 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357415  normal  0.0600742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0788  fatty acid desaturase  53.35 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0567815  normal  0.0980312 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  51.17 
 
 		 399 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2642  Fatty acid desaturase  50.77 
 
 		 389 aa  418  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2775  Fatty acid desaturase  50.77 
 
 		 389 aa  418  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  51.03 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  51.03 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2594  fatty acid desaturase  52.19 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583715  normal  0.31679 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2141  Fatty acid desaturase  50.9 
 
 		 389 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.623834  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  51.29 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2450  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  49.48 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  52.58 
 
 		 407 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  51.56 
 
 		 403 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  51.56 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  51.04 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1828  fatty acid desaturase  51.66 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.665494  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  50.52 
 
 		 407 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3432  fatty acid desaturase  50.39 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.820989  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  50.39 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  49.22 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3182  fatty acid desaturase  50.78 
 
 		 404 aa  391  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0170  fatty acid desaturase family protein  50.13 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2641  Fatty acid desaturase  51.65 
 
 		 398 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  47.56 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  49.87 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  47.3 
 
 		 384 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  50.39 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3890  fatty acid desaturase  50 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  48.84 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1709  fatty acid desaturase  47.96 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5276  fatty acid desaturase  47.68 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5583  fatty acid desaturase  47.68 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0042  fatty acid desaturase  47.12 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03593  fatty acid desaturase  43.85 
 
 		 405 aa  340  4e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4419  fatty acid desaturase  39.78 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1595  fatty acid desaturase (stearoyl-CoA desaturase)  28.63 
 
 		 253 aa  109  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0170967  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4048  fatty acid desaturase  29.96 
 
 		 256 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295457  normal  0.0470616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1354  fatty acid desaturase  28.29 
 
 		 271 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3564  fatty acid desaturase  28.63 
 
 		 249 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392803  normal  0.531214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3484  fatty acid desaturase  27.9 
 
 		 244 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4336  fatty acid desaturase  26.83 
 
 		 251 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  hitchhiker  0.00142365 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  30.38 
 
 		 306 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.17 
 
 		 303 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1136  fatty acid desaturase  30.17 
 
 		 248 aa  93.2  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00601185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.58 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10163  fatty acid desaturase  28.14 
 
 		 246 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0451  fatty acid desaturase  27.08 
 
 		 248 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.41 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.97 
 
 		 312 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1686  fatty-acid desaturase  27.2 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.726488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.73 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  31.15 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.57 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  27.16 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.3 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  26.53 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  33.33 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.99 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.51 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.14 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.51 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.45 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16070  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.78 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.98 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2261  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.59 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0125553  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.81 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32330  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.82 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  24.69 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>