181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1709 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3890  fatty acid desaturase  94.4 
 
 
393 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5276  fatty acid desaturase  89.57 
 
 
393 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5583  fatty acid desaturase  89.57 
 
 
393 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1709  fatty acid desaturase  100 
 
 
393 aa  805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230119  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0579  fatty acid desaturase  59.34 
 
 
400 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  normal  0.245726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0812  putative transmembrane fatty acid desaturase  58.82 
 
 
398 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2641  Fatty acid desaturase  60.96 
 
 
398 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3154  fatty acid desaturase  58.82 
 
 
398 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357415  normal  0.0600742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2237  fatty acid desaturase family protein  58.82 
 
 
398 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0317102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1130  fatty acid desaturase family protein  58.82 
 
 
397 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2653  fatty acid desaturase family protein  58.82 
 
 
398 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1028  fatty acid desaturase family protein  58.82 
 
 
398 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0972  fatty acid desaturase family protein  58.82 
 
 
397 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0976  fatty acid desaturase family protein  58.82 
 
 
398 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2107  fatty acid desaturase family protein  58.82 
 
 
397 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0775  fatty acid desaturase family protein  58.06 
 
 
397 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1896  fatty acid desaturase  57.54 
 
 
398 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2554  fatty acid desaturase  57.29 
 
 
398 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2507  fatty acid desaturase  57.54 
 
 
398 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2532  fatty acid desaturase  57.54 
 
 
398 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2425  fatty acid desaturase  57.03 
 
 
398 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0695745  hitchhiker  0.0000498345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5839  Fatty acid desaturase  57.29 
 
 
397 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0788  fatty acid desaturase  57.8 
 
 
397 aa  474  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0567815  normal  0.0980312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4419  fatty acid desaturase  85.61 
 
 
273 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  52.94 
 
 
396 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  52.94 
 
 
396 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2450  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  52.3 
 
 
398 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  51.02 
 
 
397 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  50.89 
 
 
399 aa  418  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  50.38 
 
 
412 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3432  fatty acid desaturase  53.98 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.820989  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  51.29 
 
 
396 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2594  fatty acid desaturase  52.05 
 
 
390 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583715  normal  0.31679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  52.67 
 
 
403 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  52.67 
 
 
403 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2642  Fatty acid desaturase  51.78 
 
 
389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2775  Fatty acid desaturase  51.52 
 
 
389 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1828  fatty acid desaturase  54.06 
 
 
389 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.665494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  51.53 
 
 
407 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2141  Fatty acid desaturase  51.79 
 
 
389 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.623834  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  52.16 
 
 
404 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  51.52 
 
 
407 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  51.03 
 
 
399 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  51.84 
 
 
407 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  50.13 
 
 
399 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3182  fatty acid desaturase  51.15 
 
 
404 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0217  fatty acid desaturase  49.48 
 
 
394 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0241  fatty acid desaturase  49.23 
 
 
394 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  48.6 
 
 
404 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0232  fatty acid desaturase  49.48 
 
 
394 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  47.31 
 
 
394 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03730  putative fatty acid desaturase  48.07 
 
 
392 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0377  putative fatty acid desaturase  48.07 
 
 
392 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4995  fatty acid desaturase  48.84 
 
 
394 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.702334  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4308  fatty acid desaturase  47.96 
 
 
396 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  47.16 
 
 
412 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3748  fatty acid desaturase  49.36 
 
 
392 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  49.23 
 
 
407 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  46.39 
 
 
394 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0618  hypothetical protein  45.64 
 
 
395 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0601  hypothetical protein  45.64 
 
 
395 aa  357  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  45.13 
 
 
395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0170  fatty acid desaturase family protein  48.59 
 
 
446 aa  349  5e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0042  fatty acid desaturase  49.49 
 
 
400 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931019 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  43.59 
 
 
384 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  43.59 
 
 
384 aa  344  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03593  fatty acid desaturase  46.72 
 
 
405 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1595  fatty acid desaturase (stearoyl-CoA desaturase)  30.33 
 
 
253 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0170967  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10163  fatty acid desaturase  28.74 
 
 
246 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  34.69 
 
 
303 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  34.02 
 
 
300 aa  100  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0451  fatty acid desaturase  28.4 
 
 
248 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  33.76 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3484  fatty acid desaturase  27.54 
 
 
244 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  31.56 
 
 
270 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1354  fatty acid desaturase  27.94 
 
 
271 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149217  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  33.47 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4048  fatty acid desaturase  27.38 
 
 
256 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295457  normal  0.0470616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4336  fatty acid desaturase  26.72 
 
 
251 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  hitchhiker  0.00142365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1686  fatty-acid desaturase  28.15 
 
 
246 aa  90.1  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.726488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.58 
 
 
302 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3564  fatty acid desaturase  27.8 
 
 
249 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392803  normal  0.531214 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.8 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.2 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  29.66 
 
 
358 aa  87  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  28.81 
 
 
272 aa  86.7  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1136  fatty acid desaturase  25.71 
 
 
248 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00601185  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.53 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.34 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.34 
 
 
274 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  28.63 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.48 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.88 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28.33 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.13 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.88 
 
 
272 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.51 
 
 
280 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6429  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.52 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  31.58 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1717  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.38 
 
 
287 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.534578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>