190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2132 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2132  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  75.36 
 
 		 286 aa  431  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.529991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  62.77 
 
 		 283 aa  354  8.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.10851  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  54.74 
 
 		 282 aa  322  5e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1928  tRNA synthetase class II (G H P and S)  53.09 
 
 		 284 aa  315  6e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0074  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  48.39 
 
 		 282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  29.45 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  32.52 
 
 		 401 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  23.15 
 
 		 410 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  22.29 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  26.2 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  23.1 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  21.91 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.55 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.55 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  29.37 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  22.71 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0324  histidyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  21.89 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.67 
 
 		 420 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 		 408 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  23.88 
 
 		 414 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0640  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.63 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226727 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.11 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.11 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.67 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.11 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 427 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2173  tRNA synthetase class II (G H P and S)  25.66 
 
 		 375 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl366  histidyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 457 aa  54.3  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0615  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  25.69 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.542186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1335  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.58 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 		 470 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 418 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1940  tRNA synthetase class II (G H P and S)  21.9 
 
 		 394 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.89 
 
 		 420 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.89 
 
 		 420 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.24 
 
 		 420 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 421 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 423 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  23.26 
 
 		 417 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4683  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  24.07 
 
 		 382 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.416531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  24.04 
 
 		 383 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 419 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.71 
 
 		 401 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000998206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.09 
 
 		 392 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 419 aa  52.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0813  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.5 
 
 		 420 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.493486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  23.7 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 414 aa  52  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 		 424 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 419 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  22.76 
 
 		 445 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 		 410 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 		 418 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  20.98 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  25.68 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 		 423 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 		 408 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  23.05 
 
 		 410 aa  49.7  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  24.65 
 
 		 421 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1555  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.81 
 
 		 535 aa  49.7  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 425 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0436  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.22 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  30.13 
 
 		 418 aa  49.7  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  23.9 
 
 		 421 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 408 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 435 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0923  Histidine--tRNA ligase  22.59 
 
 		 370 aa  49.3  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00438339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 		 415 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 		 415 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.41 
 
 		 438 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.94 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf392  histidyl-tRNA synthetase  23.57 
 
 		 417 aa  48.5  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.438879  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>