233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0428 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0428  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.773422  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2202  hypothetical protein  58.85 
 
 
204 aa  251  5.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.480648  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  53.85 
 
 
194 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  53.85 
 
 
194 aa  209  3e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0077  hypothetical protein  51.44 
 
 
205 aa  207  6e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  53.33 
 
 
193 aa  204  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0449  hypothetical protein  52.82 
 
 
194 aa  203  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1712  protein of unknown function UPF0029  50.25 
 
 
196 aa  190  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0720  Xaa-Pro dipeptidase  50.25 
 
 
194 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0524  thymidylate synthase  51.11 
 
 
191 aa  162  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  39.16 
 
 
211 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  41.6 
 
 
198 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  42.4 
 
 
290 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  39.29 
 
 
194 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  39.29 
 
 
239 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.73 
 
 
221 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  35.15 
 
 
208 aa  100  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  41.46 
 
 
198 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  40.71 
 
 
213 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  40.98 
 
 
192 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  41.8 
 
 
191 aa  99  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  42.4 
 
 
195 aa  98.2  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  44.92 
 
 
194 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  40.68 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  37.41 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  35.16 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  41.46 
 
 
245 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  37.59 
 
 
198 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  39.22 
 
 
213 aa  95.5  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  44.35 
 
 
195 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  44.35 
 
 
195 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  44.35 
 
 
195 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  42.28 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.75 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1726  protein of unknown function UPF0029  34.19 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  36.73 
 
 
212 aa  94.7  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  36.36 
 
 
200 aa  94.7  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  43.1 
 
 
204 aa  94.7  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  32.08 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  43.2 
 
 
197 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  34.57 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  43.48 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  45.13 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  40 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  45.13 
 
 
303 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  44.07 
 
 
194 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  42.86 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  43.2 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  45.13 
 
 
303 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  45.13 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  42.86 
 
 
195 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  45.13 
 
 
303 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  45.13 
 
 
303 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  44.35 
 
 
195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  41.88 
 
 
207 aa  92  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  30.89 
 
 
213 aa  92  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  42.48 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  45.83 
 
 
196 aa  91.7  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  36.14 
 
 
206 aa  91.3  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  39.68 
 
 
199 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  33.66 
 
 
186 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  34.67 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  39.13 
 
 
190 aa  89.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  41.8 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  40.52 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  40.52 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  44 
 
 
197 aa  89  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  42.61 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  40.52 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  35.09 
 
 
195 aa  89  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  42.11 
 
 
204 aa  89  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  35.17 
 
 
204 aa  89  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  37.59 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  40.31 
 
 
194 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  40.31 
 
 
194 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  31.01 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  36.36 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  40.35 
 
 
193 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  42.98 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  39.02 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  32.35 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  40.18 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  42.98 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  29.02 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  33.7 
 
 
200 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  31.55 
 
 
212 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  36.99 
 
 
204 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  36.75 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  41.44 
 
 
204 aa  87  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  40.18 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  41.32 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  45.05 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  32.24 
 
 
204 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  32.97 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  40.18 
 
 
197 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  36.71 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  31.28 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  40.87 
 
 
203 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>