232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00461 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  93.72 
 
 		 207 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  68.69 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  70.3 
 
 		 210 aa  281  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  59.32 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  53.73 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  53 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  53 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  53 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  57.06 
 
 		 203 aa  201  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  58 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  57.92 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  54.21 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  47.74 
 
 		 204 aa  187  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  56.84 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  56.84 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  56.84 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  56.84 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  51.67 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  56.32 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  55.26 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  55.26 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  55.26 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  55.26 
 
 		 205 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  55.26 
 
 		 205 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  55.26 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  55.26 
 
 		 204 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  55.26 
 
 		 204 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  50.28 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  41.58 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  44.09 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  48.99 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  40.32 
 
 		 274 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  45.88 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  42.19 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  41.58 
 
 		 204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  42.71 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  42.63 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  37.88 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  42.19 
 
 		 204 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  41.76 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  41.05 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  43.41 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  38.95 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  40.53 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  38.86 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  41.21 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  44.94 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  43.27 
 
 		 176 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  41.12 
 
 		 208 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  39.81 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  38.86 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.77 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  38.57 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  37.23 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  40 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  39.51 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  37.04 
 
 		 198 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  34.8 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  33.17 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  33.66 
 
 		 211 aa  124  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.66 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  40.22 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  35.57 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.5 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  36.02 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  33.66 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  35.86 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  38.29 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  33.66 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  36.46 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  34.63 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  37.99 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  33.17 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  33.17 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.17 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.17 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  33.17 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  33.17 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  38.78 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  36.46 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  37.29 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  39.58 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  35.05 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  35.59 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  46.15 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  34.54 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  36.87 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  35 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  34.95 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  33.83 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  33.67 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  33.97 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  34.31 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  35.33 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  37.8 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  37.8 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  37.8 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>