233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2202 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2202  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.480648  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0428  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  58.85 
 
 
211 aa  251  5.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.773422  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0077  hypothetical protein  57.35 
 
 
205 aa  224  6e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  55.08 
 
 
193 aa  204  9e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1712  protein of unknown function UPF0029  51.28 
 
 
196 aa  199  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  50.54 
 
 
194 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0720  Xaa-Pro dipeptidase  48.97 
 
 
194 aa  193  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  51.08 
 
 
194 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0449  hypothetical protein  49.46 
 
 
194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0524  thymidylate synthase  47.28 
 
 
191 aa  153  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  44.19 
 
 
198 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  30.77 
 
 
213 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  41.86 
 
 
198 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  39.16 
 
 
200 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  36.13 
 
 
198 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  45.22 
 
 
190 aa  102  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  45.61 
 
 
207 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  38.13 
 
 
219 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  37.36 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  40.52 
 
 
201 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  39.37 
 
 
192 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  40.14 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  37.79 
 
 
232 aa  99  4e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  99  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  34.64 
 
 
195 aa  99  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  33.91 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  40.5 
 
 
204 aa  98.6  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  39.37 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  33.12 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  33.54 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  36.77 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1726  protein of unknown function UPF0029  34.69 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  43.75 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  42.98 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  37.32 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  42.86 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  40.77 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  38.24 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  33.16 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  39.69 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  44.25 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  35.21 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  45.1 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  40.32 
 
 
290 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  42.48 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  32.04 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  42.48 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  29.95 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  45.95 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  30.36 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  39.02 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  41.59 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  42.48 
 
 
303 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  32.7 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  36.96 
 
 
245 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  42.48 
 
 
303 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  42.48 
 
 
303 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  42.48 
 
 
303 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  36 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  89  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  40.5 
 
 
207 aa  89  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  42.73 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  36.81 
 
 
194 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  42.74 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  44.12 
 
 
204 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  30.56 
 
 
209 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  44.12 
 
 
211 aa  88.6  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  39.67 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  39.67 
 
 
194 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  35.56 
 
 
195 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  35.56 
 
 
195 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  43.14 
 
 
176 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  35.56 
 
 
195 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  39.67 
 
 
194 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  34.74 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  41.82 
 
 
204 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  34.78 
 
 
219 aa  87.8  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  38.84 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  34.97 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  43.14 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  38.73 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.71 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  38.3 
 
 
212 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  40.91 
 
 
204 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  41.82 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  42.11 
 
 
204 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  31.69 
 
 
196 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  39.67 
 
 
242 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  33.54 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  41.96 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  34.52 
 
 
212 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  32.04 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.56 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  40.68 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  32.56 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  35.57 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>